Missions

Sous la direction du Dr. Giulia Bertolin, responsable de l'équipe Biologie Mitochondriale et
Intégration avec le Cycle Cellulaire, L'ingénieur-e travaillera sur la création et la validation de
lignées de cellules de mammifère modifiées par l'approche CRISPR/Cas9 (knock-out et/ou knock-in) pour
l'imagerie mitochondriale à l'aide de biosenseurs fluorescents.

Activités

- Choisir, développer et adapter les protocoles pour le design des stratégies CRISPR/Cas9 KO, KI et
KO/KI au locus
- Suivre la production des clones modifiés et vérifier l'efficacité des protocoles expérimentaux
(PCR, génotypage, séquençage, western blot, immunofluorescence etc.)
- Savoir proposer et implémenter des stratégies et protocoles alternatifs si besoin
- Participer aux efforts de clonage et de biologie moléculaire de l'équipe en sens large (clonage
classique, mutagenèse etc.), et à l'établissement des lignées cellulaires transgéniques avec les
produits de clonage obtenus
- Valider des lignées transgéniques par microscopie de fluorescence quantitative (confocale,
FRET/FLIM, super résolution par ex.) sur des échantillons vivants ou fixés
- Analyser les données expérimentales produites, et ceci avec des approches de microscopie, de
biochimie et/ou de protéomique
- Mettre en forme des résultats et des protocoles pour transmission au sein de l'équipe lors des
réunions périodiques
- Encadrer et former les étudiants, doctorants et postdoc de l'équipe aux techniques de biologie
moléculaire selon les nécessités de chaque projet
- Assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité en vigueur à l'IGDR en
lien avec les assistants de prévention (des formations seront proposées)
- Assurer l'application des principes et des règles de traçabilité des protocoles et des données
informatiques en vigueur à l'IGDR
- Assurer une veille scientifique dans le domaine des techniques de biologie moléculaire maitrisées.
- Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations orales à
l'échelle régionale ou nationale, et de publications.

Compétences

- Connaissance approfondie et mise en œuvre des approches de biologie moléculaire, de clonage et de
manipulation génétique par CRISPR/Cas9
- Connaissance approfondie des techniques de biologie cellulaire (culture cellulaire, transfection,
préparation d'échantillons pour des expériences de microscopie, de biochimie et de protéomique).
- Concevoir des protocoles expérimentaux et les mettre en œuvre
- Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité
- Cadre légal et déontologique
- Informatique appliquée aux techniques de biologie moléculaire et cellulaire
- Connaissance et mise en œuvre des logiciels spécifiques aux techniques mises en œuvre (par exemple
: logiciels d'analyse de séquences d'ADN, de design d'oligonucléotides, de quantification d'images
etc.
- Rédiger des documents scientifiques (par exemple : rapports, comptes-rendus, présentations etc.)
- Gérer les relations avec des interlocuteurs (par exemple : les différents membres de l'équipe, des
étudiants niveau Master, des collaborateurs)
- Langue anglaise : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Contexte de travail

L'IGDR comprend 16 équipes, 200 permanents dans un contexte international. La recherche couvre des
sujets en biologie cellulaire, en biologie du développement, bénéficiant de systèmes modèles
classiques et encourageant l'interdisciplinaire, à l'interface entre la physique et la biologie.
L'institut bénéficie de la proximité d'équipements de pointe, en microscopie
(https://microscopie.univ-rennes1.fr/).

La recherche dirigée par G.Bertolin, CR CNRS, se concentre sur l'étude de la relation entre
mitochondrie et cycle cellulaire. Deux axes d'exploration :
1. Comprendre comment la mitochondrie change ses fonctions au cours du cycle cellulaire. L'équipe
crée, valide des outils, des approches de microscopie de fluorescence à la pointe
2. Explorer les voies de signalisation qui régulent la relation entre mitochondrie et cycle
cellulaire. L'équipe explore avec 3 niveaux de résolution : au niveau de la mitochondrie unique, du
réseau mitochondrial d'une cellule et au niveau tissulaire. Nous nous concentrons sur la
signalisation régulée par les protéines du cycle cellulaire qui agissent directement à la
mitochondrie. L'équipe est soutenue par des financement régionaux, nationaux et internationaux.
Elle collabore avec des équipes nationales, internationales, apportant son savoir-faire et ses
compétences (https://igdr.univ-rennes.fr/equipe-biologie-mitochondriale-et-integration-avec-le-
cycle-cellulaire)
L'ingénieur-e sera sous la responsabilité hiérarchique de la responsable d'équipe.