Missions

L'ingénieur en bioinformatique et biostatistiques (spécialité « omics ») recueille, traite et analyse
des données massives issues de technologies omics et NGS (Chip-Seq, Methylome, RNA seq,
métagénomique, méta-transcriptomique, intégration de données), sur des modèles biologiques différents
(microalgues et bactéries)., champignons, bactéries...).

Activités

Activités principales
- Mettre en place et optimiser les procédures de recueil et de contrôle des données massives
issues de technologies omics et NGS
- Réaliser le traitement des données massives
- Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques ou d'études et
d'interfaces web
- Organiser la mise en forme, le stockage des données
- Assurer la maintenance des bases de données créées
- Adapter les applications informatiques aux besoins du projet
- Conseiller et former aux techniques et outils développés
- Définir les procédures d'assurance qualité et veiller à leur mise en œuvre
- Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

Activité spécifique ou transverse
- Gérer et maintenir des équipements et outils informatiques partagés

Compétences

Savoirs / connaissances
- Biologie (connaissance générale)
- Protocoles expérimentaux (connaissance approfondie) permettant de générer des données
massives issues de technologies omics et NGS (ex RNA seq, génomique, métagénomique et méta-
transcriptomique, illumina et PAC bio, Nanopore, Chip seq, méthylomes...)
- Recueil, analyse et traitement des données (connaissance approfondie)

Savoir-faire
- Traiter des données
- Interagir avec des biologistes et des informaticiens
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
- Transmettre des connaissances
- Utiliser les techniques de présentation

Savoirs-être
- Sens de l'organisation
- Sens critique
- Travail en équipe

Contexte de travail

La personne recrutée effectuera ses missions de recherche en soutien à l'équipe « Epigénomique des
Microalgues et Interactions avec l'Environnement » dont les activités génératrices de données
massives sont en très forte croissance. Elle travaillera en réseau avec d'autres personnels de
l'unité pour la gestion des équipements et outils informatiques.

Elle sera sous la responsabilité hiérarchique du responsable de l'équipe de recherche