Missions

L'assistant-e ingénieur-e travaillera:

- pour 80% de son temps au LBTI (UMR5305) à la synthèse peptidique et au développement de la
production et de la purification de protéines recombinantes en systèmes procaryotes ou eucaryotes.
- pour 20% de son temps à la SFR Biosciences (UAR3444), sur la plateforme Protein Science Facility
(PSF) et sera en charge de la synthèse peptidique et des activités de biochimie préparative. Dans ce
cadre, et au même titre que pour ses activités au LBTI, sa mission sera d'assurer la production, la
purification et la caractérisation de peptides nécessaires aux projets de recherche des membres du
LBTI et des usagers de la plateforme PSF (académiques ou industriels). Il-elle participera également à
la gestion des équipements de biochimie et à la formation des usagers de PSF sur ces équipements mis à
leur disposition.

Activités

Synthétiser des peptides:
- Planifier la stratégie de synthèse peptidique par méthode Solid phase Peptide Synthesis en
fonction de la séquence et de la quantité requise
- Proposer aux chercheurs des devis correspondants au prix de synthèse
- Préparer les réactifs nécessaires à la synthèse peptidique
- Réaliser la synthèse sur synthétiseur automatique
- Effectuer les étapes de clivage, de précipitation et de lyophilisation des peptides
- Purifier les peptides par HPLC préparative
- Caractériser les peptides par HPLC analytique et spectrométrie de masse
- Rédiger des fiches techniques pour les peptides purifiés
- Ajuster les stratégies de production en fonction des résultats obtenus et des besoins des équipes
Produire des protéines recombinantes :
- Conseiller les chercheurs sur les systèmes de productions en fonction du type de protéine, de sa
localisation cellulaire et des modifications post-traductionnelles
- Transformer les bactéries, optimiser les conditions de culture (température, induction, etc) et
adapter les volumes de culture aux rendements attendus
- Réaliser des transfections stables ou transitoires de lignées cellulaires et produire les
surnageants de culture de cellules en suspension ou adhérentes
- Optimiser les protocoles de purification (par chromatographie d'affinité, échange d'ions,
filtration sur gel) en fonction des besoins spécifiques de chaque projet
- Contrôler la qualité des protéines purifiées
- Ajuster les stratégies de production en fonction des résultats obtenus
Gérer les équipements:
- Entretenir les incubateurs, centrifugeuses, systèmes de chromatographie FPLC, synthétiseur de
peptides, systèmes HPLC et lyophilisateur
- Gérer les stocks de consommables et de réactifs
- Prendre en charge les déchets

Compétences

Savoirs:
- Formation en chimie des protéines et peptides
- Connaissances en biotechnologie et/ou biochimie et/ou biologie moléculaire ou équivalent

Savoir-faire:
- Maîtrise de la synthèse en phase solide sur résine et du clivage de la résine.
- Maîtrise de l'utilisation de systèmes HPLC préparative et analytique.
- Connaissance des différents systèmes d'expression de protéines recombinantes (bactéries, levures,
cellules de mammifères/insectes)
- Connaissance des techniques de purification de protéines et de biochimie classique (FPLC,
électrophorèse, western-blot )
- Aptitude à concevoir et évaluer en parallèle plusieurs stratégies de production et de purification
des protéines
- Connaissances en spectrométrie de masse

Savoir-être:
- Rigueur, organisation et aptitude à travailler en laboratoire, afin d'assurer la traçabilité et
reproductibilité des synthèses.
- Capacité au travail et à la communication en interaction avec des interlocuteurs variés
- Capacité d'organisation et de gestion des priorités.
- Intérêt pour l'innovation
- Aptitude à la rédaction de procédures techniques et de rapports d'analyses
- Bonne maitrise de l'anglais écrit et oral

Contexte de travail

Le LBTI, UMR 5305, est localisé au cœur du bio-campus de Gerland à Lyon. Cette unité se consacre à
l'étude des tissus biologiques (composantes matrice extracellulaire et cellules) et à la conception
de nouvelles approches thérapeutiques. Elle offre un environnement scientifique unique et dynamique
et a un besoin soutenu de personnel hautement qualifié et motivé pour renforcer son potentiel de
recherches. Dans ce cadre, l'agent AI en sciences biologiques devra soutenir les équipes ayant
besoin de produire des protéines pour des applications variées (validation d'hypothèses générées in
silico, études biochimiques et structurales, production d'antigènes pour la vaccination etc).
Au LBTI, l'agent sera affecté au sein de l'équipe ROAD : « Recherche OstéoArticulaire et Dentaire »
et travaillera sous l'autorité du co-responsable de cette équipe. L'agent sera aussi amené à
travailler de manière rapprochée avec les équipes MatrHyCut (Metalloproteinases and Hypoxia in
Extracellular Matrix Remodelling) et ECMO (Etude et Conception de Molécules biologiques actives) du
LBTI notamment pour mettre en œuvre des projets de production de protéines en cellules de mammifères
(activité actuellement non disponible).
Par ailleurs, l'agent sera mutualisé pour 20 % de son temps sur la plateforme Protein Science
Facility de la SFR Biosciences (UAR3444) et localisée dans le même bâtiment (IBCP, UAR3760).
Les demandes croissantes de synthèse de peptide représentent actuellement environ 20 peptides par
an. L'utilisation de peptides peut également intéresser d'autres équipes au LBTI, par exemple pour
modéliser des fragments de composés de la matrice extracellulaire, ou pour fonctionnaliser des
biomatériaux ou nanoparticules avec des peptides bio-actifs.
Poste mutualisé, à 80 % au sein du LBTI et à 20 % au sein de la SFR Biosciences
Travail en pièce de culture BSL
Travail hors horaires habituels (jours fériés, weekends) possible de façon exceptionnelle