Missions

L'ingénieur (H/F) participera au développement et à la mise en application des méthodes liées à l'exploitation d'un nouveau microscope électronique 3D du plateau MRI-EM4Bio (Montpellier Ressources Imagerie- Electron Microscopy for Biologists) en réponse aux questions scientifiques posées par les utilisateurs (préparation d'échantillons, acquisition et analyse d'images).

Activités

- Prendre en charge la réalisation de projets scientifiques soumis au plateau MRI-EM4Bio en faisant appel aux équipements du plateau et à d'autres équipements disponibles à Montpellier si nécessaire (microscopie électronique à transmission ou à balayage, microscopie photonique, micro-tomographie à rayons X.)
- Conseiller les utilisateurs pour la mise en place de leurs expériences (choix de la technique, contrôles, acquisition et analyse).
- Former les utilisateurs du plateau MRI-EM4Bio à la préparation des échantillons, à l'ultramicrotomie, à l'utilisation du microscope électronique à balayage et à l'analyse d'image
- Développer des protocoles et des méthodes pour répondre à de nouveaux besoins, prendre en charge de nouveaux types d'échantillons ou utiliser de nouveaux équipements.
- Assurer la maintenance des équipements du plateau, aider au diagnostic des problèmes de fonctionnement, être au contact des SAV des fournisseurs.
- Assurer une veille scientifique et technologique relative à la microscopie électronique
- Participer à des réseaux professionnels nationaux et internationaux
- Respecter et faire appliquer les règles relatives à la manipulation des produits dangereux
- Respecter les procédures de fonctionnement de la plateforme MRI (norme ISO9001 et NFX50-900)
- Participer à la gestion administrative, financière et organisationnelle du plateau
- Participer à la vie du LPHI et de la plateforme MRI

Compétences

1- Connaissances :
Connaissance approfondie en biologie cellulaire
Connaissance approfondie des méthodes 2D et 3D en microscopie électronique : préparation d'échantillon, principe de fonctionnement des différents types de microscope électroniques et de leurs principaux accessoires.
Connaissance approfondie des techniques de base en analyse d'image,
Connaissance des approches par apprentissage automatique et apprentissage profond en analyse d'image

2- Compétences opérationnelles/savoir-faire :
Concevoir, mettre en œuvre, et réaliser des expériences en microscopie électronique.
Maîtrise des approches en microscopie électronique 3D : serial block face et array tomography
Maîtriser des outils d'analyse d'images mis en jeu en microscopie électronique
Savoir adapter ou concevoir des protocoles en fonction de la question biologique
Concevoir des documents pédagogiques
Réaliser une veille bibliographique dans le domaine de la microscopie électronique
S'adapter à différents interlocuteurs
Savoir rendre compte
Travailler en équipe et au sein d'une plateforme multisites
Savoir gérer son activité dans un calendrier et un cadre complexe
Communiquer à l'écrit et à l'oral en français et en anglais B1/B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)

3- Compétences comportementales/aptitudes :
Sens du service
Sens relationnel
Capacité d'écoute
Sens de l'organisation
Capacité d'adaptation
Réactivité
Rigueur/fiabilité
Sens de l'initiative
Autonomie/Confiance en soi

Contexte de travail

Les activités de recherche au sein du LPHI sont structurées autour de 2 axes principaux, 1 axe Parasitologie, et 1 axe utilisant la larve de poisson Zèbre comme modèle principal pour l'études des interactions hôtes-pathogènes. Le plateau EM4Bio est un atout majeur pour les équipes de LPHI impliquées dans l'étude des interactions hôte-pathogène, dans les modèles cellulaires et chez le poisson Zèbre. Le plateau EM4Bio est également ouvert à l'ensemble de la communauté scientifique et au secteur privé en tant que plateau MRI (Montpellier Ressources Imagerie). MRI est une plate-forme technologique multi-sites de Biocampus, labellisée IBiSA, membre de l'infrastructure nationale France BioImaging, elle est certifiée ISO 9001 - NFX50-900. Le plateau MRI-EM4Bio a pour objectif d'offrir une gamme de services en microscopie électronique unique dans la région Occitanie et encore rare en France, allant de la préparation d'échantillon, à l'acquisition des images en 2D et en 3D et à l'analyse d'image. Le plateau est équipé d'un microscope électronique à balayage Zeiss Gemini 360, équipé du module de coupe sériée automatique in situ (serial block face) Volutome de Zeiss, qui est unique en France. Le plateau s'est équipé d'un congélateur haute pression permettant la cryofixation des échantillons biologiques nécessaire au développement des méthodes de microscopie corrélative qui font l'objet d'une forte demande de la part de la communauté scientifique Montpelliéraine. Un nouvel ultramicrotome de dernière génération Leica UC Enuity advanced a été installé en Novembre 2025 il permettra de mettre en œuvre des technique complexes de ciblage de zone d'intérêt pour la microscopie électronique 3D. Le plateau est dans une vraie dynamique d'innovation depuis son ouverture avec l'installation de nouveaux équipements et avec la construction d'une équipe aujourd'hui dirigée par une Ingénieure de recherche CNRS affectée à 50% au plateau et deux agents contractuels (IE et T).