Informations générales
Intitulé de l'offre : Thèse de doctorat (H/F) en biologie: visualiser les choix cellulaires par l'imagerie de la transcription
Référence : UMR9002-EDOBER-008
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : lundi 23 septembre 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 novembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2135,00 € brut mensuel
Section(s) CN : Organisation, expression, évolution des génomes
Description du sujet de thèse
Les cellules adoptent des destins différents et le séquençage d’ARN sur cellule unique a révélé que cela se produit via des « trajectoires cellulaires », dans lesquelles le transcriptome d’une cellule évolue d’un état épigénétique donné à un autre, et ce d'une manière bien définie. Cette vue dynamique est reconstruite a posteriori à partir d'instantanés de cellules situées à différents points le long des trajectoires. Ainsi, nous ignorons comment une cellule se déplace le long de telles trajectoires et comment les choix cellulaires sont effectués. Ici, le doctorant abordera cette question fondamentale en développant de nouvelles méthodes permettant la visualisation de la transcription dans des cellules uniques en temps réel. Le candidat utilisera comme modèle des cellules souches embryonnaires de souris (mES) se différenciant en neurones. Le projet se fera en étroite collaboration avec une équipe de mathématiques appliquées, où un autre doctorant modélisera les réseaux de régulation génétique impliqués.
Contexte de travail
Equipe Edouard Bertrand à l'IGH (équipe Biologie Cellulaire de l'ARN).
https://www.igh.cnrs.fr/en/research/departments/genetics-development/biologie-cellulaire-de-larn
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques
Quelques heures de travail le week-end pour la culture des cellules souches.