Description du sujet de thèse

Les cellules adoptent des destins différents et le séquençage d’ARN sur cellule unique a révélé que cela se produit via des « trajectoires cellulaires », dans lesquelles le transcriptome d’une cellule évolue d’un état épigénétique donné à un autre, et ce d'une manière bien définie. Cette vue dynamique est reconstruite a posteriori à partir d'instantanés de cellules situées à différents points le long des trajectoires. Ainsi, nous ignorons comment une cellule se déplace le long de telles trajectoires et comment les choix cellulaires sont effectués. Ici, le doctorant abordera cette question fondamentale en développant de nouvelles méthodes permettant la visualisation de la transcription dans des cellules uniques en temps réel. Le candidat utilisera comme modèle des cellules souches embryonnaires de souris (mES) se différenciant en neurones. Le projet se fera en étroite collaboration avec une équipe de mathématiques appliquées, où un autre doctorant modélisera les réseaux de régulation génétique impliqués.

Contexte de travail

Equipe Edouard Bertrand à l'IGH (équipe Biologie Cellulaire de l'ARN).
https://www.igh.cnrs.fr/en/research/departments/genetics-development/biologie-cellulaire-de-larn

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Quelques heures de travail le week-end pour la culture des cellules souches.