Doctorant en « Evo-Immuno : Innovations de l’immunité innée antivirale des chauves-souris Myotis » H/F
Nouveau
- CDD Doctorant
- 36 mois
- Doctorat
This offer is available in English version
Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Centre International de Recherche en Infectiologie
Type de Contrat
CDD Doctorant
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
69364 LYON 07
Durée du contrat
36 mois
Date d'Embauche
01/11/2026
Rémuneration
La rémunération est de 2 300€ brut mensuel
Postuler Date limite de candidature : mardi 23 juin 2026 23:59
Description du Poste
Sujet De Thèse
Thèse de Doctorat sur l’évolution fonctionnelle de l’immunité innée antivirale des chauves-souris du genre Myotis (directrice de thèse : Lucie ETIENNE, CIRI, ENS-Lyon)
Ce projet de recherche de doctorat vise à identifier et caractériser les innovations génomiques, en particulier duplications de gènes et réarrangements de domaines protéiques, responsables des spécificités antivirales des chauves-souris du genre Myotis. Le doctorant ou la doctorante caractérisera l'histoire évolutive et fonctionnelle des gènes de l'immunité innée de Myotis, en collaboration avec des membres de l’équipe experts en bio-informatique/génomique/phylogénétique, et identifiera ceux qui sont responsables de réponses antivirales spécifiques. Pour cela, il/elle utilisera les modèles cellulaires multi-individus/espèces et virologiques récemment développés au laboratoire, dans des criblages perte de fonction et gain de fonction antivirale, grâce à une plateforme d'imagerie confocale à haut débit avec marquage fluorescent cellulaire et viral. La caractérisation évolutive et mécanistique d’une à trois innovations immunitaires sera réalisée.
Le doctorant ou la doctorante aura ainsi des activités interdisciplinaires, principalement de virologie moléculaire, immunité innée et biologie cellulaire d’espèces non-modèles, mais également de phylogénomique et protéomique.
- Il ou elle réalisera et développera des protocoles expérimentaux de réplications virales en laboratoires de sécurité de niveau 2 et 3, manipulation génétique de cellules de mammifères, biologie cellulaire (lignées cellulaires humaines et autres mammifères, FACS, microscopie confocale à fluorescence à haut débit), biochimie et biologie moléculaire (clonage, western blot, qPCR, extractions ARN/ADN).
- Il ou elle réalisera et développera des analyses bio-informatiques de deux ordres : d’une part l’analyse des données d’imagerie haut débit, et d’autre part les analyses phylogénomiques/protéomiques des gènes d’intérêt.
- Ensemble des activités spécifiques à une formation doctorale.
Compétences attendus :
Compétences en biologie cellulaire, biologie moléculaire, virologie, immunologie.
Compétences en bio-informatique.
Une expérience préalable ou une formation en analyse de données d’imagerie est un plus.
Une expérience préalable ou une formation en biologie évolutive est un plus, mais pas un prérequis.
Une excellente communication en anglais est attendue.
.
Votre Environnement de Travail
La thèse sera réalisée au CIRI. Le CIRI rassemble des communautés de recherche scientifique et médicale en infectiologie de Lyon-St Etienne avec pour tutelles principales l’Université Lyon 1, l’Inserm, le CNRS et l’ENS de Lyon, tutelles secondaires les Hospices Civils de Lyon et l’Université Jean Monnet, en partenariat avec VetAgroSup et l’Institut Pasteur. Ce sont plus de 400 chercheurs et chercheuses d’horizons disciplinaires complémentaires regroupés en 3 spécialités principales immunologie, bactériologie, virologie. L’objectif principal est la compréhension de la biologie des microbes et du système immunitaire, et des interactions entre les microbes et leurs hôtes afin de mieux lutter contre les maladies infectieuses et autres maladies impliquant le système immunitaire.
Le laboratoire de thèse est l’équipe LP2L/HIVE située à l’ENS de Lyon, et en particulier l’Axe de Recherche animé par Lucie Etienne : Évolution fonctionnelle des interactions virus-hôte, et impact sur les transmissions inter-espèces. https://ciri.ens-lyon.fr/teams/lp2l/projects
Les moyens nécessaires pour réaliser les missions et les activités seront mis à disposition.
Contraintes et risques
Déplacements internationaux pour des conférences ou des collaborations.
Travail en environnement BSL-3.
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est de 2 300€ brut mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR5308-CARLAZ-013 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Relations hôte-pathogène, immunologie, inflammation |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
Créer une alerte
Ne manquez aucune opportunité de trouver le poste qui vous correspond. Inscrivez-vous gratuitement et recevez les nouvelles offres directement dans votre boite mail.