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Thèse en imagerie optique fonctionnelle sans marquage (H/F)

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Informations générales

Référence : UMR5298-PIEBON-002
Lieu de travail : TALENCE
Date de publication : mardi 30 juin 2020
Nom du responsable scientifique : Pierre Bon
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 7 septembre 2020
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2 135,00 € brut mensuel

Description du sujet de thèse

Alors que l'utilisation de sondes fluorescentes permet une imagerie hautement spécifique d'un sous-ensemble précis de molécules de l'échantillon, nous manquons toujours d'information d'environnement, obtenue sans marquage.

Nous développons une nouvelle approche d'imagerie basée sur la mesure de la composante de phase de la lumière après interaction avec l'échantillon vivant. Cela permet de révéler en lumière blanche les plus fines structures de l'échantillon (Bon et al., Biophys. J., 2014). Cette approche est désormais suffisamment mature pour une utilisation dans le cadre de la caractérisation fonctionnelle d'échantillons biologiques vivants de la cellule adhérente jusqu'au tissu.

Le but de la thèse proposée est d'extraire des paramètres biophysiques permettant d'étudier le lignage et la sénescence de cellules sans avoir recours in fine au marquage fluorescent. Cette approche permettra l'étude du développement de tissus in vitro sans perturbation de ces derniers et sur des durées d'observation longue.

Contexte
- Utilisation de l'imagerie de phase dans un contexte d'imagerie tissulaire
- Observation d'échantillons biologiques épais et denses
- Couplage à d'autres modalités d'imagerie existantes (fluorescence, spectroscopie Raman...)
- Développement de nouvelles stratégies d'extraction de l'information


Compétences attendues
- Imagerie optique (théorique et expérimentale)
- Interférométrie
- Programmation (Labview, Python/matlab)
- Faculté d'organisation & autonomie
- Culture cellulaire
- Goût pour l'interdisciplinarité

Contexte de travail

Le laboratoire Photonique Numérique et Nanoscience (LP2N) situé sur l'Université de Bordeaux est mondialement reconnu pour ses recherches dans le domaine de l'optique.

L'équipe de recherche "Nanobiomicroscopy" au sein du LP2N développe des nouvelles techniques d'imagerie optique pour la biologie.

En particulier, au sein de l'ERC Starting "SpeciPhic", Pierre Bon développe de nouvelles approches d'imagerie sans marquage pour l'étude des tissus biologiques. C'est dans cette équipe projet que le/la candidat(e) travaillera à plein temps.

Contraintes et risques

Pas de contrainte particulière

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