Thèse : mécanisme moléculaire du transporteur ABC de multiples drogues, BmrA (H/F)

Description du Poste

Sujet De Thèse

Contexte scientifique :
La résistance à de multiples drogues (MDR) chez les bactéries représente une menace majeure pour la santé mondiale, compromettant l'efficacité des traitements antibiotiques. Les transporteurs de médicaments polyspécifiques jouent un rôle clé dans cette résistance, en permettant l’efflux d’une large gamme d’antibiotiques hors de la cellule. BmrA, un transporteur de type ATP-Binding Cassette (ABC), sert de modèle pour étudier ces mécanismes.

Questions clés :
Une question centrale est de comprendre comment BmrA peut expulser une si grande variété de médicaments, et en particulier, si son état de repos nécessite une conformation largement ouverte pour accommoder les molécules les plus volumineuses. Par ailleurs, il est établi que différents médicaments peuvent se lier simultanément au transporteur et déclencher un mécanisme de transport coopératif, mais cette coopérativité reste mal comprise.

Contexte du projet :
Ce projet est financé par l’ANR-DFG (une collaboration bilatérale franco-allemande) et vise à répondre à ces questions en adoptant une approche multidisciplinaire, combinant :
• Biologie moléculaire (ex. : mutagénèse dirigée ; production et purification de protéines membranaires (surexpression et purification de BmrA sauvage (WT) et mutant)) ;
• Caractérisation fonctionnelle (tests d’activité ATPase ; tests de transport de médicaments ; études de liaison aux médicaments (ex. : Calorimétrie de Titration Isotherme, tests basés sur la fluorescence)) ;
• Biologie structurale (microscopie électronique par cryo-EM pour déterminer les structures 3D de BmrA WT et mutant).

Profil du candidat :
Nous recherchons un doctorant hautement motivé, avec une solide formation en biochimie et un vif intérêt pour la biologie structurale et la biophysique. Une expérience ou des connaissances en protéines membranaires et en techniques de biologie structurale seraient un atout. Le candidat doit être curieux, passionné par la recherche et motivé pour étudier les protéines membranaires à l’interface de la biochimie, de la biologie structurale et de la biophysique.

Processus de candidature :
Les candidats doivent soumettre :
• Un CV ;
• Une lettre de motivation détaillant leurs intérêts de recherche et leur motivation ;
• Les noms et coordonnées de deux référents.
Contacts : jean-michel.jault@ibcp.fr et cedric.orelle@ibcp.fr

P.S. Cette offre de thèse correspond à celle que nous avons récemment publié sur LinkedIn. Si vous nous avez déjà soumis votre candidature et que nous ne l’avons pas retenue car votre profil ne correspondait pas à ce que nous recherchions, merci de ne pas candidater à nouveau.


Publications pertinentes du laboratoire :
• Di Cesare et al. (J. Biol. Chem., 2024). L’activité de transport du transporteur ABC multidrogue BmrA ne nécessite pas une large séparation des domaines de liaison des nucléotides.
• Pérez Carrillo et al. (Nat. Commun., 2025). Communication bidirectionnelle entre les sites de liaison des nucléotides et des substrats dans un transporteur ABC multidrogue de type IV.

Votre Environnement de Travail

Laboratoire d’accueil : Unité de recherche Microbiologie Moléculaire et Biochimie Structurale (MMSB), campus de Gerland (Lyon).
Tutelles : Unité mixte sous la supervision du CNRS et de l’Université Lyon 1.
Axes de recherche : Comprendre les mécanismes moléculaires de la pathogénie microbienne et des interactions macromoléculaires (structure, dynamique et fonction).
Environnement de travail :
Situé à proximité du centre-ville de Lyon, avec un accès facile aux transports en commun (métro, tram, pistes cyclables). Infrastructures modernes et une ambiance collaborative et bienveillante. Opportunités de formation et de participation à des conférences

Rémunération et avantages

Rémunération

2300€ brut mensuel

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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