Description du sujet de thèse

Le projet SymbioCues vise à caractériser précisément l'initiation de la symbiose entre les coraux et leurs partenaires bactériens les plus abondants. Comprendre comment les bactéries associées aux coraux deviennent symbiotiques n'est pas seulement essentiel pour la santé des coraux juvéniles, mais il permettra également important de comprendre le rétablissement des symbioses dans les coraux adultes à la suite de stress environnementaux. Ces résultats permettront également d'élucider l'impact a long terme des manipulations du microbiome corallien et la manière dont ces approches peuvent être utilisées pour ralentir la dégradation actuelle des récifs coralliens.
Le/la candidat(e) sera amené(e) à :
o Mettre en place un projet de recherche visant à caractériser l'initiation de la symbiose corail-bactéries.
o Mener à bien des expériences en aquarium et en laboratoire afin suivre la colonisation des coraux par les bactéries.
o Écrire un doctorat et des publications scientifiques.
o Présenter les résultats au sein de l'université et en conférences

Les compétences attendues sont :
o Expertise et connaissances en microbiologie, biologie moléculaire et génie génétique
o Compétence dans la mise en œuvre d'expérience sur le terrain et en laboratoire
o Capacité à mettre en place un programme de recherche (rédaction du projet de thèse, synthèse bibliographique)
o Bonne compétence en analyses statistiques pour développer des protocoles scientifiques adéquats et leurs analyses ultérieures
o Capacité de travail en équipe et transmission du savoir-faire

Contexte de travail

Les coraux abritent une étonnante diversité de micro-organismes, dont les plus abondants sont les microalgues endosymbiotiques et les bactéries. Ces micro-organismes échangent des nutriments avec leurs hôtes et sont essentiels à leur santé et à l'écosystème qu'ils soutiennent. Malgré les fortes interactions entre le corail et ses symbiotes microbiens, plus de 70 % des espèces de coraux ne transmettent pas leurs symbiotes à leur progéniture, qui doivent être acquis à partir de l'environnement.
Les coraux abritent une étonnante diversité de micro-organismes, dont les plus abondants sont les microalgues endosymbiotiques et les bactéries. Ces micro-organismes échangent des nutriments avec leurs hôtes et sont essentiels à leur santé et à l'écosystème qu'ils soutiennent. Malgré les fortes interactions entre le corail et ses symbiotes microbiens, plus de 70 % des espèces de coraux ne transmettent pas leurs symbiotes à leur progéniture, qui doivent être acquis à partir de l'environnement.

Contraintes et risques

Le doctorat se déroulera principalement en laboratoire (biologie moléculaire, microscopie) à Perpignan et inclura l’isolation, l’indentification et l’utilisation de bactéries symbiotiques associées aux coraux. Une mission de collecte d’échantillon d’environ un mois aura lieu chaque année à Mo’orea, en Polynésie Française