Missions

Etudes spectroscopiques et mécanistiques de modèles peptidiques d'enzymes LPMO.

Activités

La biomasse lignocellulosique est considérée comme une matière première renouvelable pour produire des produits chimiques biosourcés, des biomatériaux et des biocarburants avancés. Dans ce contexte, les Lytic Polysaccharide Monooxygenases (Cu-LPMO), des enzymes à cuivre, capables de promouvoir le clivage des polysaccharides étendus en utilisant des mécanismes oxydatifs sont donc des objets d'intérêt.
Une nouvelle ligne de recherche repose sur l'étude structurale et fonctionnelle de catalyseurs bioinspirés à base de peptides courts. Certains des échafaudages peptidiques choisis de conception assez simple, sont capables de reproduire les caractéristiques clés du site de coordination du Cu(II) de l'enzyme et les complexes Cu(peptides) ainsi obtenus montrent une activité prometteuse en oxydation vis-à-vis d'un substrat modèle. L'objectif du projet est d'élargir les familles de peptides, avec des modifications rationnelles pour améliorer l'activité catalytique des complexes Cu-peptides.
1) Synthèse peptidique
- Mise en œuvre de la synthèse sur automate assisté par micro-ondes,
- Récupération des peptides bruts à partir de la résine,
- Purification des peptides, par purification chromatographique : chromatographie flash, HPLC-MS en modes semi-préparatif et préparatif.
- Contrôle qualité des peptides synthétisés : HPLC, RMN, MS.
- Participation à la maintenance du synthétiseur de peptides
2) Mise en œuvre d’études en criblage de l'oxydation de substrats modèles (cellobiose, substrats modèles non polysaccharidiques) par suivi en UV-Vis et Fluorescence.
-Préparation des échantillons à étudier
-Rédaction du protocole d’étude (une expérience correspond au criblage de plusieurs conditions expérimentales)
-Programmation et entretien des analyseurs (spectromètres)
-Contrôle du bon déroulement de l’acquisition des données
-Analyse des données
-Rédaction d’un rapport par expérience et présentation des résultats lors des réunions d’équipe et de conférences.
3) Etudes spectroscopiques et analytiques des mécanismes oxydatifs par UV-Vis, RPE, RMN, IR, dichroïsme circulaire, Fluorescence et électrochimie.
-Mise en forme des données acquises dans un tableur et analyse des données obtenues.
-Rédaction d’un rapport par expérience et présentation des résultats lors des réunions d’équipe et de conférences.


- Travail en équipe

Compétences

- Très bonne compétence en chimie bio-inorganique, chimie analytique, chimie des peptides,
- Expérience robuste en analyses physico-chimiques et biochimiques, en particulier spectroscopiques (UV-Vis et fluorescence),
-Une connaissance de la synthèse peptidique sur support solide est un plus,
- Maîtrise des outils informatiques généraux (Office) et spécifiques au domaine (Kaleidagraph).
- Organisation et gestion du temps de travail pour la réalisation des expériences dans des délais définis.
- Aptitude au travail en équipe.

Contexte de travail

Le travail sera très principalement réalisé au Laboratoire de Chimie de Coordination du CNRS (UPR 8241) dans l’équipe « Alzheimer, Amyloïdes et Chimie Bio-Inorganique » dirigée par le Dr. Christelle Hureau.

Contraintes et risques

Manipulations de produits chimiques.