Post doctorat (H/F) en résolution structurale cryo-TEM d’un polymère conducteur

Description du Poste

Les Missions

Le post-doctorant / la post-doctorante contribuera à la description structurale à l’échelle moléculaire d’un complexe polymère (PEDOT :PSS) dont la structure reste largement débattue dans la communauté scientifique mondiale. Il s’agira de transférer et adapter les approches, développées en biologie structurale pour la reconstruction de structures cryo-TEM, en chimie.
Le projet est financé par le CNRS Chimie.

L'Activité

L’objectif de ce projet de recherche est d’obtenir un modèle 3D à l’échelle quasi-atomique des fibres de PEDOT:PSS (polymère pi-conjugué, semi-conducteur) présentes en dispersion dans l’eau. Ce complexe de polymères est de référence dans de nombreux domaines de l’énergie (photovoltaïque, thermoélectricité, capteur, etc.), de la bioélectronique ou du biomédical aussi bien au niveau industriel qu’académique. L’approche utilisée pour révéler la structure est la combinaison de (1) la cryo- microscopie électronique à transmission (cryo-TEM) à haute résolution et (2) l’analyse d’images par des logiciels comme RELION ou cryoSPARC. Cette méthodologie a déjà été largement exploitée en biologie structural mais encore trop peu pour des polymères Notre objectif est donc d’utiliser les mêmes approches pour le PEDOT :PSS. À partir de jeux de données cryo-TEM en haute résolution, il s’agira d’analyser les structures présentes dans les micrographies et de réaliser une sélection des objets selon leur morphologie. Une étape d’optimisation des paramètres de traitement d’images contribuant à l’obtention de classes 2D moyennes sera ensuite nécessaire. Par la suite, il sera possible de vérifier la qualité des classes 2D par des analyses comparatives de diffusion de rayons X. L’objectif final est d’obtenir une reconstruction 3D et d’affiner le modèle structural en prenant en compte les données de diffusion de rayons X (SAXS-WAXS) et la littérature sur la structure du PEDOT :PSS.
Cette méthodologie déjà développée dans notre laboratoire reste à être appliquée aux polymères. Il s’agit d’un travail exploratoire et novateur. L’absence de consensus scientifique mondial permettra d’illustrer comment la cryo-TEM et la reconstruction d’images peuvent apporter des éléments de réponse majeurs.

Votre Profil

Compétences

• Formation (Master et /ou doctorat) en biologie structurale ou reconstruction d’images cryo-TEM.
• Reconstruction de structures à partir d’images cryo-TEM.
• Maîtrise de RELION ou cryoSPARC.
• Une compétence en reconstruction de systèmes hélicoïdaux serait un plus.
• Utilisation d’un système d’exploitation sous Linux pour le développement de code (bash, python) et d’analyses d’images.
• Gestion des données scientifiques massives (images et traitement) et analyse bibliographique critique sur les méthodes à l’état de l’art.
• Méthodes de communication en milieu multidisciplinaire (chimie-physique, microscopie et analyse d’images).
• Autonomie dans la gestion d'un projet scientifique.
• Communication scientifique (rapports, présentations orales, articles).
• Anglais scientifique courant (écrit et oral) niveau B2-C1.

Votre Environnement de Travail

Le projet de recherche sera réalisé au sein de l’équipe SYFOS (Systèmes Fonctionnels Structurés), l’une des sept équipes de l’Institut Charles Sadron. L'ICS est un institut de recherche du CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) associé à l'Université de Strasbourg (Unistra) internationalement reconnu pour ses activités de recherche en science des macromolécules et des systèmes auto-assemblés. Le projet sera réalisé au sein d’une équipe multidisciplinaire composée de Laure Biniek (experte en polymères conjugués), Alexis Bigo—Simon (spécialiste en auto-assemblage, traitements d’images et reconstruction structurale 3D), Marc Schmutz (expert en cryo-TEM) et Jérôme Combet (spécialiste de diffusion des rayons X). Le post-doctorant / la post-doctorante travaillera également en collaboration avec le personnel des plateformes de microscopie électronique et de diffusion des RX de l’ICS.
L’environnement informatique comprendra également des stations de calcul avec des cartes graphiques de dernière génération ainsi qu’un nouveau cluster de calcul interne en cours de déploiement.

L’Institut Charles Sadron investit dans des équipements scientifiques de pointe, favorisant une recherche innovante. L’institut de recherche a mis en place différentes commissions contribuant à la bonne qualité de vie au travail et représentativité des personnels techniques et CDD. Le laboratoire est engagé dans une démarche de développement durable et de réduction de son impact environnemental. Le site web du laboratoire est consultable pour plus de détails : https://www.ics-cnrs.unistra.fr/presentation.html

L’Institut Charles Sadron se situe dans une zone à régime restrictif (ZRR), dans une zone à régime restrictif (ZRR), dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation en vigueur, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche.

Contraintes et risques

Pas de contraintes ni de risques particuliers.

Documents à fournir : un CV détaillé comprenant les publications scientifiques et communications orales, une lettre de motivation (en lien avec le projet proposé) et deux lettres de référence (dont au moins une par un expert en reconstruction de structures).

Rémunération et avantages

Rémunération

à partir de 3071,50 € bruts mensuels selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

Le CNRS

Les métiers de la recherche