En poursuivant votre navigation sur ce site, vous acceptez le dépôt de cookies dans votre navigateur. (En savoir plus)
Portail > Offres > Offre UMS3601-VALSAI-033 - Développeur•euse full stack pour la surveillance génomique COVID-19 H/F

Développeur•euse full stack pour la surveillance génomique COVID-19 H/F


Date Limite Candidature : mardi 29 juin 2021

Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler. Les informations de votre profil complètent celles associées à chaque candidature. Afin d’augmenter votre visibilité sur notre Portail Emploi et ainsi permettre aux recruteurs de consulter votre profil candidat, vous avez la possibilité de déposer votre CV dans notre CVThèque en un clic !

Faites connaître cette offre !

Informations générales

Référence : UMS3601-VALSAI-033
Lieu de travail : EVRY COURCOURONNES
Date de publication : mardi 18 mai 2021
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 15 juin 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : à partir de 2151,32€, à adapter selon expérience professionnelle
Niveau d'études souhaité : Bac+3
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Dans le cadre du projet national EMERGEN, l'IFB est chargé de déployer un environnement numérique pour la surveillance génomique et la recherche concernant les maladies infectieuses émergentes. Pendant les deux premières années, le projet sera consacré au traitement des données COVID-19, mais l'environnement numérique couvrira à plus long terme l'ensemble des maladies infectieuses émergentes. Le développement de cette plateforme numérique sera assuré par une équipe incluant des compétences en DevOps, développement de bases de données et de logiciels, gestion des données et analyse des données.

Le développeur full stack sera chargé de développer la base de données qui accueillera l'ensemble des données produites par le consortium de laboratoires de séquençage, de l'équiper d'interfaces conviviales et programmatiques, et d'assurer son déploiement sur les serveurs EMERGEN. Il s'intégrera dans la task force mutualisée de l'IFB, dont il bénéficiera de l'appui et contribuera au développement du réseau national de ressources de calcul et stockage de l'IFB (National Network of Computing Resources).

Activités

Activités principales :
- Développer une application Web Django, équipée d'interfaces humaines et programmatiques
- Gérer l'intégration des données dans cette base de données
- Rédiger documentations pour les usagers, les administrateurs et les développeurs
- Participer au réseau régional et national de l'IFB
- Assurer une veille technologique

Activités associées :
- Présenter ses activités : webinar, réunions de travail...
- Participer à l'assistance et au support utilisateur.

Compétences

Formation : DUT ou BTS en informatique ou niveau au moins équivalent

Compétences techniques requises:
- Maîtrise du framework de développement Django
- Bonne Connaissance de Java script et des technologies web
- Bonne connaissance des Librairies graphiques, par exemple: plotly, chartJS, ...
- Bonne connaissance du modèle objet et des principaux patrons de conception (design patterns).
- Bonne connaissance des outils de test (unitaire) et des bonne pratique en qualité logiciel
- Bonne connaissance de l'outil de versionning Git et des outils associés: Github, Gitlab Bonne connaissance de l'intégration et du déploiement de services Web et API sur une infrastructure (django/python)
- Bonne connaissance Conception et requêtage de bases de données SQL
- Connaissance de docker et docker compose
- Compréhension de l'anglais oral et écrit.

Compétences techniques appréciées:
- Bonne connaissance des cycles de développement en intégration continue
- Connaissance des méthodes d'authentification et des annuaires (openLDAP, OpenID connect, Keycloak)
- Connaissance des outils et technologies WEB (NGINX, Apache, etc.).
- Connaissance d'un outil de déploiement automatique (Ansible, Salt, ...).
- Connaissance des environnements Linux
- Culture du Logiciel Libre et Open Data

Savoir-être :
- Capacité à travailler en mode projet et en équipe.
- Réactivité, autonomie, initiative, rigueur.
- Gérer les situations d'urgence et hiérarchiser les priorités.
- Esprit d'équipe et sens de la collaboration.
- Capacité d'écoute et sens du contact.
- Capacité à travailler en réseau, avec les outils numériques modernes (messagerie instantanée, visioconférence)..

Contexte de travail

L'Institut Français de Bioinformatique (IFB ; france-bioinformatique.fr) est une infrastructure nationale en biologie-santé qui fédère 35 plateformes régionales et équipes associées, ainsi qu'une unité coordinatrice, IFB-core (UMS CNRS 3601). L'IFB est également le nœud français de l'Infrastructure de Recherche européenne en bioinformatique ELIXIR (ESFRI).

L'IFB a pour missions : (1) de mettre en place un service national en bioinformatique, accessible à tous les chercheurs en sciences du vivant, sous la forme d'une infrastructure environnée (stockage, calcul, environnement logiciel, bases de données, serveurs Web nationaux, support aux usagers, accompagnement de projets, formations, …) ; (2) de répondre à l'évolution rapide des technologies et des besoins ; (3) d'anticiper les futurs développements du domaine ; (4) d'assurer la représentation des services bioinformatiques français au niveau international ; (5) de favoriser l'engagement des communautés des sciences du vivant dans les projets nationaux et internationaux associés à la bioinformatique ; (6) d'assurer le transfert des connaissances et technologies entre les laboratoires de recherche français et le monde industriel; (7) d'assurer le lien entre les activités des bioinformaticiens Français et celles de l'infrastructure européenne ELIXIR.

Attention, pour des raisons administratives le poste est affiché sur Evry, mais la personne sera recrutée sur l'un des sites d'implantation de l'IFB impliqués dans le projet EMERGEN. Ceci inclut notamment les plateformes suivantes : ABIMS (Roscoff), BigEst (Strasbourg), MMG-GBIT (Marseille), BIRD (Nantes), GenoToul (Toulouse), MIGALE (Jouy-en-Josas). La personne s'intégrera dans son équipe d'accueil, et participera aux groupes de travail de l'IFB pertinents pour sa mission. Le travail sera réalisé sur site et en télétravail. Le travail nécessitera des déplacements occasionnels en France et à l'étranger pour participer à des réunions de travail, des formations ou des événements scientifiques.

On en parle sur Twitter !