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Ingénieur d'étude ou de recherche en bioinformatique (H/F)


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Informations générales

Référence : UMR9189-HELTOU-001
Lieu de travail : VILLENEUVE D ASCQ
Date de publication : jeudi 1 août 2019
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 octobre 2019
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2200 et 2500 bruts mensuels selon diplôme et expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

La mission s'inscrit dans le cadre de l'ANR ASTER (Algorithms and software for third generation RNA sequencing). L'objectif est le développement de bibliothèques logicielles pour l'analyse des longues lectures de séquençage d'ADN et d'ARN (ONT par exemple), en s'appuyant sur les résultats théoriques de nature algorithmique obtenus par le consortium.

Activités

Activités principales
- analyse des algorithmes
- choix de structures de données
- mise en oeuvre informatique
- constitution de jeux de tests
Activités secondaires
- présentations et communication

Compétences

Le candidat doit être titulaire d'un master de bioinformatique ou d'informatique, ou d'un diplôme d'ingénieur en bioinformatique ou informatique.

- programmation en C++
- algorithmique
- bioinformatique du séquençage à haut débit
- génie logiciel, intégration continue
- anglais scientifique et technique

Contexte de travail

La personne retenue sera membre de l'équipe de recherche Bonsai, au sein de l'UMR CRIStAL (http://www.cristal.univ-lille.fr/bonsai/), sous la responsabilité hiérarchique d'Hélène Touzet. Cette équipe travaille en bioinformatique avec applications aux données de séquençage à haut débit. Le projet est en colaboration avec le Génoscope (Evry, CEA), l'Institut Pasteur de Lille et le LBBE (Université de Lyon 1 et CNRS).

Contraintes et risques

Néant

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