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ingénieur de recherche analyse des donnees biologique H/F


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Informations générales

Référence : UMR9002-SOFKOS-014
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : lundi 3 février 2020
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 15 mars 2020
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2200 Euros net
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

· L'ingénieur de recherche en traitement de données biologiques réalise l'expertise et le traitement de données d'IMGT®, the international ImMunoGenetTics information system® (http://www.imgt.org).
· L'ingénieur de recherche est responsable en particulier du traitement de données en immunogénétique (immunoglobulines ou antibodies, récepteurs T, et protéines de la superfamille des immunoglobulines (IgSF).
· L'ingénieur de recherche fait des analyses de la génomique comparative et contribue a l'éctriture des rapports/ articles.

Activités

· Définir le plan d'études et mettre en place les procédures de recueil et de contrôle des données issues des travaux de recherche en immunogénétique.
· Contribuer à l'analyse de nouveaux projets d'annotation et de biocuration et de bioinformatique au sein de l'équipe IMGT®.
· Réaliser l'analyse, l'expertise et le traitement des données de locus d'immunoglobulines et de récepteurs T (nouvelles espèces), et des protéines de la superfamille IgSF au sein de l'équipe IMGT®.
· Adapter si nécessaire les outils bioinformatiques aux besoins du projet d'annotation et de biocuration, de la mise en forme et du stockage des données.
· Alimenter les bases de données et contrôler leurs cohérences.
· Créer, modifier les pages Web dans le domaine
· Assurer la veille technique et scientifique
· Diffuser et valoriser des résultats sous formes de rapports ou d'études à usage des communautés professionnelles et scientifiques.

Compétences

Connaissance dans le domaine de l'immogénétique, de la biologie moléculaire et de l'immunoinformatique
Comprendre et interpréter une problématique dans le domaine
Utilisation des sites biologiques et bioinformatiques (NCBI, ENSEMBL …) et d'outils d'analyse et de recherche de données (BLAST, FASTA, ALIGN …)
Connaître un langage de programmation orienté web (HTML, CSS …)
Maîtriser les techniques de présentation (écrites et orales)
Connaissance des environnements Unix et Windows
Anglais, bon niveau écrit et oral

Contexte de travail

Les conditions de travail sont décrites dans le règlement intérieur de l'IGH.

Contraintes et risques

Travail devant l'écran.

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