Missions

Objectif.
Caractérisation biochimique d’enzymes clés impliquées dans le métabolisme de l'alginate chez les algues brunes. La méthodologie appliquée fera appel à la production et à la caractérisation des enzymes recombinantes correspondantes.

État des lieux
Les algues brunes sont des éléments essentiels des écosystèmes côtiers [1]. Elles représentent une biomasse riche mais sous-exploitée qui a un rôle à jouer pour relever les défis mondiaux [2]. Elles sont également largement exploitées pour l'extraction de l'alginate, utilisé dans l'industrie des hydrocolloïdes [3]. L'alginate est un polysaccharide essentiel de la paroi cellulaire des algues brunes, et un acteur clé dans les fonctions biologiques chez ces organismes [4]. Paradoxalement, nous n'avons qu'une compréhension partielle du métabolisme de ce polysaccharide, par des ‘enzymes actives sur les carbohydrates’ ou CAZymes. Bien que nous ayons identifié de nouveaux gènes candidats [5,6], la caractérisation biochimique des protéines correspondantes reste à établir.

[1] Pessarrodona A et al. (2022). Science Advances 8, eabn2465. https://doi.org/doi:10.1126/sciadv.abn2465
[2] Farghali M et al. (2022) Environmental Chemistry Letters 21, 97-152. https://doi.org/10.1007/s10311-022-01520-y
[3] Hurtado A, (2022). International Journal of Molecular Sciences 23, 4486. https://doi.org/10.3390/ijms23094486
[4] Mazéas L et al. Seminars in Cell & Developmental Biology 134, 112-124. https://doi.org/10.1016/j.semcdb.2022.03.005
[5] Denoeud F, et al. (2024). Cell 187, 6943-6965.e6939. https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.04
[6] Mazéas et al. (2024). BMC Genomics 25, 950. https://doi.org/10.1186/s12864-024-10811-3

Activités

• Analyse des gènes candidats à partir de la vaste base de données génomiques interne pour les algues brunes, Phaeoexplorer.
• Etablir et commander les séquences à synthétiser pour une future expression hétérologue.
• Tester l'expression dans des systèmes hétérologues modèles procaryotes et/ou eucaryotes.
• Optimiser les conditions de culture pour améliorer l'expression soluble des protéines.
• Effectuer la caractérisation biochimique des enzymes produites. Trois familles distinctes de CAZymes sont ciblées, couvrant des activités biochimiques distinctes.
• Interprétation et valorisation des résultats (publication(s), conférences)

Compétences

Compétences recherchées
Nous recherchons une personne qui possède de solides compétences dans la production de protéines recombinantes, en biochimie et en glycobiologie. Une expérience préalable dans la production de protéines recombinantes en cellules d'insectes serait un avantage. De bonnes aptitudes de communication en anglais, à l’oral et à l’écrit, sont attendues. La personne doit être autonome, capable de s'adapter et de travailler en équipe.

Eligibilité
Le candidat/la candidate doit avoir obtenu un doctorat et doit obligatoirement avoir passé au moins 18 mois hors de France au cours des 3,5 dernières années. Les candidatures ne répondant pas à ces critères ne seront pas examinées.

Mode de recrutement
Seules les candidatures soumises via le portail en ligne seront prises en compte. Les candidatures envoyées par e-mail ne seront pas considérées.
La candidature, rédigée en anglais, doit inclure :
• Un curriculum vitae / CV
• Une lettre de motivation décrivant l'expérience professionnelle pertinente par rapport aux qualifications requises pour le poste, une liste détaillée des compétences pratiques et théoriques et l'intérêt pour le poste.
Les candidatures incomplètes ne seront pas examinées.
Les candidatures seront examinées au fil de leur réception et ce, jusqu’à ce que le poste soit pourvu.

Contexte de travail

Le poste est financé par la région Bretagne et sera dirigé par le Dr Cécile Hervé, responsable de l’équipe Polysaccharides des Algues Brunes dans l’unité de Biologie Intégrative des Modèles Marins à la station Biologique de Roscoff. L’unité dispose d'une renommée internationale dans les études en biologie intégrative sur les macroalgues. Elle est située au sein de la Station Biologique de Roscoff, un centre de recherche et d'enseignement marin qui emploie environ 300 personnes dans un petit village de la côte nord de la Bretagne (Roscoff), en France.

Les protéines d’algues brunes sont connues pour être difficile à exprimer sous forme recombinante, aussi le poste s’inscrit dans une approche globale sollicitant divers systèmes d’expression et qui pourra faire appel à des collaborations déjà établies par l’encadrante en Europe et/ou à l’international

Contraintes et risques

Pas de contraintes particulières