Informations générales
Intitulé de l'offre : Post-doctorant (H/F) pour le développement de la microscopie de fluorescence en molécules uniques combinée à des approches de deep learning
Référence : UMR8214-VERSAR-008
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : ORSAY
Date de publication : samedi 23 mars 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 juin 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Salaire mensuel en fonction de l'expérience, compris entre 2992,93 € et 4204,22 € brut
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Physique des atomes, molécules et plasmas. Optique et lasers
Missions
La personne recrutée fera partie de l'équipe NANOBIO et participera au développement de nouvelles approches de microscopie super-résolue, alliant le développement optique et les applications biologiques. Dans le cadre de ce poste, il s'agira de développer un microscope permettant d'observer les cellules à différentes échelles au-delà de la limite de diffraction, en appliquant soit une illumination structurée (SIM) afin de gagner un facteur 2 en résolution, soit en combinant l'illumination structurée avec la localisation des molécules uniques (technique ModLoc brevetée par l'équipe), dans une nouvelle configuration optique. Ces développements optiques se feront en parallèle de l'utilisation de nouvelles approches d'analyse de type deep learning, développées en collaboration avec l'équipe de R. Henriques. Au sein de ce consortium européen, les applications biologiques se feront en collaboration avec l'institut Curie, et une partie des développements instrumentaux/logiciels se feront avec la société Abbelight.
Le poste pourra être prolongé d'une nouvelle période de 12 mois.
Activités
La personne contribuera à différents aspects en fonction de son expérience :
- mise en place des éléments optiques pour la réalisation de ce nouveau dispositif instrumental
- utilisation/développement de nouvelles modalités d'analyse basées sur le deep learning
- tests et validation du nouveau dispositif expérimental
- programmation pilotage/simulation
- caractérisation sur différents échantillons
- rédaction d'articles
- participation à des conférences
Compétences
- optique
- microscopie
- programmation en python
- connaissances en imagerie de molécule unique (acquisition et traitement)
- connaissances en photophysique
- connaissances en culture cellulaire
Contexte de travail
Ce travail se fera au sein de l'ISMO (Unité Mixte CNRS / Université Paris-Saclay) dans le cadre d'un projet européen EIC PAthfinder impliquant 4 autres laboratoires et une entreprise (Abbelight). Le laboratoire dispose d'une salle de culture sur site et de différents microscopes pour la localisation de molécule unique.
Contraintes et risques
- faisceau laser
- culture cellulaire