Missions

Contribuer à la compréhension des mécanismes de régulation génétiques et épigénétiques des gènes de l’immunité innée codant les peptides antimicrobiens, chez la cellule épithéliale intestinale humaine.
Participer au développement d’une nouvelle stratégie thérapeutique permettant de lutter contre la résistance des bactéries aux antibiotiques par la pharmaco-modulation des gènes humains codant des peptides antimicrobiens.

Activités

Le projet postdoctoral s'inscrit dans le cadre du consortium Européen MaxImmun visant à prévenir et traiter les infections des muqueuses, et les situations de conflit pouvant exister entre un hôte et son microbiote, par le développement d’une nouvelle stratégie thérapeutique basée sur des molécules immuno-stimulatrices boostant l'expression des peptides antimicrobiens du système immunitaire. Face à la résistance des bactéries aux antibiotiques, cette stratégie thérapeutique innovante sera pertinente dans la lutte contre les infections endémiques dans les pays émergents, et face aux pathologies infectieuses ou inflammatoires rencontrées dans les pays industrialisés.
L’objectif du projet postdoctoral sera double et consistera à (i) déchiffrer les mécanismes fondamentaux de la régulation épithéliale des gènes humains codant les peptides antimicrobiens, et à (ii) caractériser le mécanisme d’action de molécules immuno-stimulatrices identifiées par criblage et capables de booster l’expression de ces gènes de l’immunité innée mucosale. Partant d’un modèle de régulation des gènes de peptides antimicrobiens développé au laboratoire, le/la candidat(e) recruté(e) étudiera les nouveaux circuits d’activation et de répression identifiés ainsi que l’impact des molécules immuno-stimulatrices sur la régulation transcriptionnelle de ces gènes.
L’activation des voies de signalisation cellulaire, le recrutement de facteurs de transcription de la réponse immunitaire, et les modifications épigénétiques prenant place au niveau du promoteur des gènes de peptides antimicrobiens seront entre autres étudiés. La fonction activatrice ou répressive de ces changements de l’environnement chromatinien au niveau de ces gènes sera évaluée au moyen d’inhibiteurs pharmacologiques, de l’extinction de gènes par siRNA, ou de l’édition du génome et de l’epigénome. In fine, ces approches permettront de mieux comprendre (i) les mécanismes fondamentaux de la régulation des gènes antimicrobiens, (ii) les mécanismes d’action des molécules immuno-stimulatrice étudiées, et (iii) de sélectionner parmi ces molécules de futurs candidats médicaments qui pourront entrer dans un pipeline de recherche et développement au sein du consortium, dans la perspective d’un essai clinique de phase I.

Compétences

Compétences
- Biologie cellulaire (cellule humaine)
- Biologie moléculaire (cellule humaine)
- Signalisation cellulaire (cellule humaine)
- Régulation génétique (cellule humaine)
- Régulation épigénétique (cellule humaine)
Connaissances
- Immunité innée humaine
- Peptides antimicrobiens et inflammation
- Signalisation cellulaire
- Mécanismes de régulation génétique et épigénétique
- Pharmacologie
- Méthodologie de conduite d’un projet de recherche
- Connaissance des principes et technique de la communication
- Langue française et anglaise : B2 à C1

Savoir-faire
- Techniques d’édition de génome et d’epigénome
- Extinction de l’expression des gènes par siRNAs
- Immunoprécipitation de la chromatine
- RNA-seq et analyse des données
- Analyse de l’expression des gènes par PCR quantitative en temps réel (qPCR)
- Analyse de la sécrétion des peptides antimicrobiens par test ELISA
- Culture de cellules humaines
- Avoir une très bonne maitrise de la langue française et anglaise (écrit et oral)
- Avoir le sens de l’organisation, l’esprit pratique et critique, et savoir anticiper
- Maîtriser les outils Excel, Word, Powerpoint, Prism

Savoir-être
- Être autonome
- Être curieux
- Être ouvert d’esprit
- Avoir le sens du relationnel
- Avoir le sens de l’anticipation
- Avoir le sens des priorités
- Avoir l’esprit d’initiative
- Avoir l’esprit de synthèse
- Être réactif et dynamique
- Être rigoureux et organisé
- Avoir le sens de la confidentialité

Contexte de travail

Le projet Européen MaxImmun repose sur un consortium constitué de six partenaires français (INSERM, CNRS, ENS), allemand (HZI), suédois (UU), et de la société de biotechnologie ImmunRise Technologies (IRT). L’objectif consiste à développer une stratégie thérapeutique innovante permettant de lutter contre la résistance des bactéries pathogènes aux antibiotiques