Missions

Dans le cadre d’un laboratoire de recherche en neuroscience moléculaire, nous ouvrons un poste d’ingénieur bio-informatique / biologie évolutive. L’ingénieur contribuera à un projet de recherche visant à décrypter l’évolution des récepteurs iGluRs chez les Eucaryotes (voir le ‘contexte scientifique’ ci-dessous). Le projet impliquera de combiner des méthodes classiques de phylogénie avec des approches alternatives à mettre au point (synténie, épissage, autre…), en lien avec des laboratoires de bio-informatiques locaux et de biologie marine. L’idée est d’aboutir à une classification ‘cross-validée’ des iGluRs au moins pour les Métazoaires ; une information importante pour les champs des iGluRs et de l’évolution moléculaire du système nerveux.

Activités

Activités principales :
- Utilisation, combinaison et développement d’outils d’analyse évolutive
- Etablissement, cross-validation et publication d’une classification des iGluRs
- Interaction avec la plateforme bio-informatique et les collaborateurs.

Activités autres :
- Approches exploratoires autour d’outils de classification alternatifs
- Veille technologique.
- Soutien bio-informatique occasionnel équipe et collaborateurs.
- Travail en collaboration, vie d’équipe et d’institut.
- Participation encadrement, diffusion scientifique et animation de réseau.

Compétences

Nous recherchons un candidat présentant des compétences techniques bioinformatiques, à la fois polyvalentes et spécialisées :

- Compétences en analyses bioinformatiques évolutives et en classification (phylogénie…)
- Compétences de programmation (python, R).
- Des connaissances dans les domaines de l’épissage, de synténie et/ou biologie structurale seraient un plus.

Vous êtes rigoureux, d’une large curiosité scientifique (évolution moléculaire, neurobiologie, biologie marine…) et prêt à explorer de nouvelles approches. Vous êtes motivé pour rejoindre une équipe active et multidisciplinaire, mêlant approches expérimentales et bio-informatiques.

Contexte de travail

Le candidat rejoindra l’équipe de Pierre Paoletti au sein de l’institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure - IBENS. L’équipe dispose d’une renommée internationale dans le champ des neurosciences moléculaires, en particulier dans l’étude de la fonction et la pharmacologie des récepteurs au glutamate (iGluRs). Elle s’appuie sur le développement d’une approche multi-échelle efficace de l’ingénierie des protéines à la physiologie synaptique. Les méthodologies classiquement employées au laboratoire comprennent une importante partie expérimentale : des tests fonctionnels pharmacologiques, de l’électrophysiologie cellulaire et de développement d’outils optopharmacologiques (et d’autres), mais celles-ci s’appuient régulièrement sur des modèles et prédictions in silico (modèles moléculaires, analyses de données structurales, docking, phylogénie…).
Le laboratoire est pleinement financé et impliqué dans un réseau de collaborateurs locaux, nationaux et internationaux. L’IBENS est un institut internationalement reconnu dédié à la recherche fondamentale en biologie : neuroscience, génomique, évolution, écologie, développement et des plateformes technologiques de haut niveau. Situé dans le centre de Paris, l’IBENS offre un environnement de travail dynamique et accueillant.

Contraintes et risques

Aucun risque ou contrainte spécifique identifié