Post-doctorat en génomique évolutive de chromosomes sexuels de champignons (H/F)
Nouveau
- Chercheur en contrat CDD
- 12 mois
- Doctorat
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Écologie Société Evolution
Type de Contrat
Chercheur en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
91190 GIF SUR YVETTE
Durée du contrat
12 mois
Date d'Embauche
01/10/2026
Rémuneration
Entre 3131,32 et 3569,85€ par mois
Postuler Date limite de candidature : vendredi 11 septembre 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Post-doctorat en génomique évolutive pour analyser l’évolution des chromosomes sexuels de champignons par des approches de génomique évolutive, au sein du laboratoire Ecologie, Société et Evolution de l’université Paris Saclay.
L'Activité
-Analyses de chromosomes sexuels à partir de jeux de données haut-débit de génomes entiers Illumina, PacBio et MinION (SNP, variants structuraux, éléments transposables)
-Analyses de génomique évolutive (phylogénomique, orthologie, sélection, synténie)
-Participation à la génération de données (participation à la gestion des souches, la culture, l’extraction d’ADN, le séquençage MinION, l’étude de la viabilité et fertilité des souches, la récolte de souches)
-Rédaction de publications
-Veille en bioinformatique et génomique évolutive
-Assurer une traçabilité et fiabilité des résultats
- Participer à la formation des nouveaux membres de l'équipe aux méthodes utilisées et aux bonnes pratiques de laboratoire
Votre Profil
Compétences
-Maîtrise des analyses bioinformatiques sur des données de séquençage à haut-débit
-Maîtrise d'au moins un langage de programmation machine (C ,C++, java), un langage de script (python, perl), du logiciel R et d’un interpréteur shell Unix
-Connaissances générales en biologie, statistiques, et connaissances approfondies en biologie de l’évolution et génomique évolutive, et particulièrement sur l’évolution des chromosomes sexuels
-Maîtrise des outils de représentation des données (par exemple réaliser des représentations graphiques en utilisant le langage R)
-Maîtrise des analyses de génomique évolutive (phylogénomique, orthologie, synténie, détection de sélection, SNP, variants structuraux, éléments transposables)
- Maîtrise des dépôts de pipelines d’analyses dans les banques publiques telles que GitHub
-Maitrise de l'anglais (oral et écrit).
- Capacité d'organisation et de planification.
- Rigueur et autonomie.
- Capacité d’initiative
- Aptitude à travailler en équipe et à s'inscrire dans des projets collectifs
- Assurer la traçabilité des données traitées et la reproductibilité des analyses réalisées
-Capacité à transmettre ses connaissances techniques et son savoir-faire
-Capacité à adapter ses compétences aux évolutions permanentes de son domaine
-Capacité à diffuser ses résultats scientifiques par écrit et par oral
-Capacité à rédiger des articles scientifiques
Votre Environnement de Travail
L’unité Ecologie, Société et Evolution (ESE) est une unité mixte de recherche CNRS, AgroParisTEch et Université Paris Saclay, qui conduit des recherches en écologie et évolution qui visent à étudier l’origine et la dynamique de la biodiversité ainsi que l’évolution et le fonctionnement des écosystèmes. L’unité est localisée sur le campus scientifique de l’université Paris-Saclay au sein de l’IDEEV (Institut Diversité Ecologie et Evolution du Vivant) et compte 125 personnes et dispose d’une serre, de laboratoires de biologie moléculaire et de culture in vitro.
Le post-doc travaillera au sein de l’équipe “Génétique et écologie évolutives”, dans le groupe de Tatiana Giraud composé d’1 DR, 1 CR, 2 MdC, 3 doctorantes, 1 IR et 1 IE. Le poste se place au sein d’un projet ERC visant à comprendre l’évolution des chromosomes sexuels de champignons. Le CDD est pour 12 mois initialement mais est prolongeable éventuellement jusque 3 ans.
Contraintes et risques
Pas de risques au-delà de ceux classiques de travail dans un bureau et laboratoire de culture in vitro et de biologie moléculaire
Rémunération et avantages
Rémunération
Entre 3131,32 et 3569,85€ par mois
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR8079-TATGIR-024 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés |
| Expérience souhaitée | 1 à 4 années |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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