Chercheur / Chercheuse post doctoral en biophysique cellulaire (H/F)
Nouveau
- Chercheur en contrat CDD
- 12 mois
- Doctorat
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Institut de Biologie du Développement de Marseille
Type de Contrat
Chercheur en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
13009 MARSEILLE 09
Durée du contrat
12 mois
Date d'Embauche
01/06/2026
Rémuneration
De 3132.32 € à 4341.70€ bruts mensuels
Postuler Date limite de candidature : mercredi 22 avril 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Rôle des hétérogénéités dans les transitions de phase des systèmes embryonnaires auto-organisés
La gastrulation est une étape cruciale du développement embryonnaire, au cours de laquelle un tissu initialement homogène se structure en couches cellulaires distinctes. Notre équipe a récemment montré que cette transition implique une dynamique mécanochimique dans des gastruloïdes, modèles in vitro dérivés de cellules souches embryonnaires (Hashmi et al., eLife 2022 ; Gsell & Tlili et al., Nature Physics 2025). Cependant, les mécanismes par lesquels les hétérogénéités locales émergent et influencent la différenciation et les comportements collectifs demeurent mal compris. Ce projet vise à élucider comment ces hétérogénéités régulent la différenciation mésodermique et les transitions épithélio-mésenchymateuses (EMT) à l'aide d’approches expérimentales innovantes.
Objectifs
1. Créer des hétérogénéités contrôlées dans les gastruloïdes via des expériences de fusion et l’activation spatiotemporelle de TBRA (Brachyury), acteur clé de transcription de la différenciation mésodermique et de la formation de la ligne primitive lors de la gastrulation.
2. Caractériser l’impact de ces hétérogénéités sur les transitions EMT et les comportements collectifs.
3. Identifier les seuils critiques (nombre, localisation, synchronisation des cellules) dans ces mécanismes
L'Activité
1. Création d’hétérogénéités contrôlées
• Expériences de fusion : Combinaison de gastruloïdes à différents stades de différenciation pour étudier l’impact des hétérogénéités sur les transitions EMT et les comportements collectifs.
• Activation spatiotemporelle de TBRA : utilisation de systèmes optogénétiques pour activer TBRA dans des sous-populations cellulaires spécifiques.
2. Caractérisation des transitions de phase
• Analyse des marqueurs EMT et mésodermiques : Immunofluorescence pour suivre les marqueurs clés (TBRA, Snail, Mesp1, E-cadherin, N-cadherin).
• Analyse mécanique des tissus en collaboration avec des biophysiciens de l’équipe
3. Développement et optimisation des protocoles
• Génération de lignées transgéniques
• Mise en place des systèmes optogénétiques : développement et validation d’un système Opto-TBRA pour son activation contrôlée.
4. Analyse des comportements collectifs
• Imagerie en temps réel : Utilisation de la microscopie confocale et multiphotonique
• Analyse des données : utilisation d’outils d’analyse d’images.
Votre Profil
Compétences
• Formation en biologie avec forte composante quantitative
• Manipulation de cellules souches embryonnaires : culture et différenciation de mESCs et/ou hESCs.
• Techniques d’imagerie avancée : microscopie confocale, immunofluorescence.
• Techniques de biologie moléculaire : clonage
• Expérience en analyse de données (Fiji, Python…)
Votre Environnement de Travail
L'IBDM situé sur le Campus de Luminy, comprend environ 220 personnes titulaires Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Ingénieurs et Techniciens et non permanents CDD, Post doc, Doctorants, stagiaires répartis sur 21 équipes de recherches et 11 plateaux techniques et services.
L'IBDM est une unité mixte de recherche sous une tutelle du CNRS et de l'AMU, qui explore le domaine de la Biologie du développement et des pathologies qui y sont associées.
L'activité s'exercera au sein de l’équipe "Approches physiques de la dynamique cellulaire et de la morphogenèse tissulaire".
Le laboratoire étant composé de plusieurs nationalités, la pratique de la langue anglaise est indispensable.
Le postdoctorant / La postdoctorante travaillera dans un environnement pluridisciplinaire (Physique, Biologie, Ingénierie).
Rémunération et avantages
Rémunération
De 3132.32 € à 4341.70€ bruts mensuels
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR7288-AUDBAR-077 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Biologie cellulaire, développement, évolution-développement |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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