CDD Post-doc en génomique de la levure (H/F)
Nouveau
- Chercheur en contrat CDD
- 12 mois
- Doctorat
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement, Nice
Type de Contrat
Chercheur en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
06000 NICE
Durée du contrat
12 mois
Date d'Embauche
01/12/2026
Rémuneration
La rémunération brute mensuelle est comprise entre 3072 € et 4613,64 € selon l'expérience professionnelle acquise antérieurement.
Postuler Date limite de candidature : lundi 9 novembre 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Le post-doctorant contribuera au projet ANR EDGES (Evolving genomes beyond species boundaries), qui étudie comment les génomes acquièrent, assimilent et font évoluer de grandes quantités d'ADN étranger et d'ADN propre supplémentaire (fsDNA) chez la levure bourgeonnante Saccharomyces cerevisiae. Il/elle pilotera des travaux sur l'absorption naturelle d'ADN environnemental, la reprogrammation de l'accouplement pour permettre l'hybridation interspécifique, et le potentiel adaptatif du fsDNA par évolution expérimentale. Il/elle collaborera également aux autres projets en cours dans l'équipe (https://ircan.org/en/research/gianni-liti).
L'Activité
Le post-doctorant réalisera des expériences et des analyses computationnelles afin de déterminer comment l'ADN étranger pénètre dans les cellules de levure, comment il y est maintenu, et quelles en sont les conséquences phénotypiques et évolutives. Tâches principales :
* Conception et utilisation d'un mini-chromosome artificiel linéaire de levure portant un rapporteur fluorescent pour mesurer l'absorption naturelle d'ADN dans différents fonds génétiques et conditions écologiquement pertinentes, incluant le tri cellulaire, la transcriptomique et la cartographie par GWAS des déterminants génétiques de la compétence naturelle
* Ingénierie d'un système d'accouplement synthétique pour lever les barrières prézygotiques et permettre l'hybridation et la cytoduction entre S. cerevisiae et des espèces éloignées non-Saccharomyces, suivies à l'échelle de la cellule unique par fluorescence et microscopie time-lapse
* Évolution adaptative en laboratoire de souches portant de l'ADN étranger ou de l'ADN propre supplémentaire sous contraintes (p. ex. température élevée, stress osmotique), avec séquençage Nanopore à lectures longues pour suivre la dynamique du fsDNA
* Phénotypage sur l'ensemble du cycle de vie de la levure (croissance, accouplement, sporulation, quiescence, vieillissement) et test de l'isolement reproductif entre lignées évoluées et ancestrales
* Caractérisation multi-omique (séquençage à lectures longues, capture de conformation des chromosomes, transcriptomique, protéomique) des clones évolués, en collaboration avec les partenaires du consortium (Sorbonne Université et Institut Pasteur)
Votre Profil
Compétences
* Une expérience préalable en génétique et génomique de la levure est indispensable
* Une connaissance approfondie de l'analyse bioinformatique de données de séquençage nouvelle génération et de solides bases en statistiques sont indispensables
* Une expérience en évolution expérimentale, biologie synthétique ou ingénierie des génomes (p. ex. CRISPR/Cas9), en cytométrie/tri cellulaire, en microscopie et en séquençage à lectures longues est souhaitée
* Bonnes capacités de communication et aptitude à travailler au sein d'un consortium multi-équipes
Votre Environnement de Travail
Le post-doctorant sera affecté à l'équipe du Dr Gianni LITI « Génomique des populations et caractères complexes ». L'équipe est l'une des équipes fondatrices de l'IRCAN et est située à la Faculté de Médecine de Nice. Elle dispose de tout l'équipement nécessaire aux expériences de génétique et de génomique de la levure et a accès à des plateformes de pointe en microscopie, cytométrie et génomique, ainsi qu'à des serveurs de calcul et de stockage. Le travail sera réalisé au sein du consortium EDGES, en étroite collaboration avec les équipes de Gilles Fischer (Sorbonne Université) et de Romain Koszul (Institut Pasteur).
Contraintes et risques
Le système avec lequel nous travaillons (la levure) est connu pour être sûr et non pathogène. Certains des produits chimiques utilisés dans les expériences sont toxiques et doivent être manipulés conformément aux instructions. Une initiation à la sécurité sera dispensée avant le début des activités expérimentales.
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération brute mensuelle est comprise entre 3072 € et 4613,64 € selon l'expérience professionnelle acquise antérieurement.
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR7284-GIALIT-023 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Organisation, expression, évolution des génomes |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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