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Portail > Offres > Offre UMR7275-FRACHA-002 - Ingénieur bioinformaticien (H/F) « Structure et fonction des macromolécules biologiques »

Ingénieur bioinformaticien (H/F) « Structure et fonction des macromolécules biologiques »


Date Limite Candidature : lundi 6 décembre 2021

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Informations générales

Référence : UMR7275-FRACHA-002
Lieu de travail : VALBONNE
Date de publication : lundi 15 novembre 2021
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 février 2022
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2130 et 2715 euros bruts selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Le (la) candidat(e) sera en charge de la mise au point d'une approche bio-informatique pour l'analyse structurale du canal ERG, incluant un système de notation de l'impact de mutations génétiques de ce canal chez le patient. A partir des données de cristallisation et d'outils informatiques disponibles en libre accès, il/elle devra élaborer une approche méthodologique permettant son utilisation par des non-initiés dans un contexte clinique.

Activités

- Prise en charge de la partie structurale du projet
- Amélioration des outils existants
- Automatisation de l'évaluation de score concernant l'impact des mutations sur la structure du canal ionique.
- Veille scientifique pour l'amélioration de la significativité statistique de l'outil proposé

Compétences

1. Maîtrise des logiciels requis pour l'analyse structural (pyMOL, UCSF CHimera, GENO3D, Alphafold …).
2. Maîtrise de la programmation en R, PYTHON.
3. Maitrise des fondamentaux de la chimie et des biostatistiques.
4. Connaissance en biologie des protéines membranaires.

Contexte de travail

Poste à pourvoir au sein de l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC) (https://www.ipmc.cnrs.fr/cgi-bin/site.cgi). Cette unité mixte de recherche sous la double tutelle du CNRS et d'Université Côte d'Azur se situe sur le campus universitaire de Sophia-Antipolis sur la commune de Valbonne. Dans le cadre d'un projet financé par l'ANR (CarDiag) et en collaboration avec l'Institut du Thorax à Nantes, la personne recrutée travaillera au sein de l'équipe « Physiologie et physiopathologie des canaux ioniques », dirigée par Florian Lesage, sous la responsabilité du Dr Franck Chatelain.

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