Chercheur en Biologie végétale H/F

Description du Poste

Les Missions

L’agent sera chargé d’élucider le rôle fonctionnel et les mécanismes d’action des protéines LMTP1 et TLP26 dans la biogenèse, la maintenance et la régulation du photosystème II (PSII) chez Chlamydomonas reinhardtii. Ses missions principales consisteront à :

- Identifier les partenaires d’interaction de LMTP1 et TLP26 au sein du PSII et d’autres complexes photosynthétiques.
- Comprendre le mécanisme moléculaire par lequel ces protéines influencent la performance photosynthétique.
- Établir un lien entre le phénotype « stay green » observé et les processus redox ou de signalisation rétrograde.
- Développer et caractériser des mutants génétiques pour valider les hypothèses in vivo.

L'Activité

A. Identification des partenaires d’interaction

- Isoler des membranes thylakoïdiennes à partir de cultures de C. reinhardtii (conditions normales et stress lumineux).
- Réaliser des traitements salins pour exposer le complexe Mn du PSII.
- Appliquer des agents de réticulation (cross-linkers) en présence de protéines recombinantes CrLMTP1 et CrTLP26.
- Collaborer avec des partenaires externes pour identifier, par spectrométrie de masse, les points de contact entre les protéines d’intérêt et les sous-unités photosynthétiques.
- Utiliser des techniques de marquage de proximité (ex : TurboID) pour cartographier l’interactome des protéines cibles.

B. Caractérisation fonctionnelle et mécanistique

- Concevoir et produire des variantes mutées des domaines TPM de LMTP1 et TLP26 (mutagenèse dirigée sur des sites clés : cystéines conservées, site de liaison au métal, etc.).
- Réaliser des essais de pull-down in vitro/in vivo pour valider les interactions identifiées.
- Mesurer l’évolution d’oxygène, la fluorescence de la chlorophylle a et le transfert d’électrons QA-QB sous différentes conditions.
- Utiliser des colorants sensibles aux métaux (ex : BODIPY) pour suivre la compartimentation du Mn dans le lumen thylakoïdien,

C. Génération et phénotypage de mutants

- Générer des mutants ponctuels de C. reinhardtii par CRISPR/Cas9 sur les sites identifiés comme critiques.
- Concevoir des constructions pour le marquage in vivo (tags fluorescents, TurboID) afin de suivre la localisation et l’interactome des protéines cibles.
- Confirmer l’édition génétique par PCR et quantifier l’expression protéique par western blot.
- Phénotyper les mutants sous différentes conditions environnementales (lumière, température, milieux de culture) et mesurer l’activité photosynthétique (fluorescence, fixation de CO₂, évolution d’O₂).
- Analyser la stabilité des complexes photosynthétiques et la distribution des protéines cibles par électrophorèse 2D.

Votre Profil

Compétences

Compétences techniques (savoir-faire)

- Maîtrise avancée des techniques de biologie moléculaire : clonage, mutagenèse dirigée, PCR, western blot.
- Expérience confirmée en biochimie des protéines : production de protéines recombinantes, purification, essais de pull-down, réticulation chimique.
- Connaissance approfondie des méthodes de spectroscopie et de mesure de l’activité photosynthétique : fluorescence de la chlorophylle, évolution d’O₂, titrations redox.
- Maîtrise des outils de génétique inverse (CRISPR/Cas9) et de transformation de Chlamydomonas reinhardtii.
- Expérience en microscopie confocale et en analyse d’images pour le suivi de protéines marquées.
- Capacité à utiliser des logiciels d’analyse de données omiques (spectrométrie de masse, interactome).

Connaissances théoriques

- Excellente compréhension de la photosynthèse, de la structure et de la fonction du PSII, et des mécanismes de biogenèse et de réparation des complexes photosynthétiques.
- Connaissance des voies de signalisation rétrograde et des processus redox dans les chloroplastes.
- Familiarité avec la physiologie des microalgues et les réponses aux stress environnementaux.

Savoir-être

- Autonomie et rigueur dans la planification et la réalisation d’expériences complexes.
- Capacité à travailler en équipe et à collaborer avec des partenaires académiques et techniques.
- Esprit d’analyse et de synthèse pour interpréter des résultats multiformes et proposer des hypothèses mécanistiques.
- Bonne communication écrite et orale (rédaction de rapports, présentations scientifiques, échanges avec les collaborateurs).

Votre Environnement de Travail

Intégré·e au sein de l’équipe Photosynthèse & Environnement (P&E) du BIAM (Biosciences et Biotechnologies d’Aix-Marseille), un laboratoire du CEA situé sur le campus de Cadarache, vous rejoindrez une équipe pluridisciplinaire dédiée à l’étude des mécanismes fondamentaux de la photosynthèse, de l’échelle moléculaire à la physiologie végétale. Notre équipe s’attache à décrypter les facteurs déterminant la performance photosynthétique chez les plantes et les microalgues, en particulier leur capacité à s’acclimater aux fluctuations de lumière et de CO₂, dans un contexte de changement climatique. Nous combinons des approches innovantes en génétique, biochimie, biophysique et modélisation, afin d’élucider les régulations fines de la capture d’énergie solaire, du transfert d’électrons, de la fixation du CO₂ et de la résilience des organismes photosynthétiques.
Le projet s’inscrit dans un environnement scientifique dynamique, bénéficiant d’un accès privilégié à des plateformes technologiques de pointe (Imaplant, Phytotec) et à des outils de phénotypage non invasifs, développés pour le suivi en temps réel des processus photosynthétiques. Vous évoluerez au cœur d’un écosystème collaboratif, en interaction avec des expert·e·s en biologie structurale, écophysiologie, biologie synthétique et modélisation systémique, et profiterez d’un réseau de collaborations académiques et industrielles, tant au niveau national qu’international. L’équipe P&E, dirigée par Jean Alric et Xenie Johnson, est reconnue pour son excellence dans l’étude des relations structure-fonction des complexes photosynthétiques, ainsi que pour ses approches translationnelles visant à optimiser la productivité des cultures et des microalgues face aux stress abiotiques.
Votre travail contribuera directement à des enjeux sociétaux majeurs, tels que l’adaptation des organismes photosynthétiques aux contraintes environnementales et le développement de solutions durables pour l’agriculture et la production d’énergie bas-carbone. Vous bénéficierez d’un cadre de travail stimulant, alliant recherche fondamentale et applications concrètes, au sein d’un institut engagé dans la transition énergétique et écologique.
L'Institut de Biosciences et Biotechnologies Aix Marseille (BIAM) est une Unité Mixte de Recherche (UMR) composée d'une centaine de salariés permanents et d'une cinquantaine de salariés non permanents (CDD, doctorants et post-doctorants, stagiaires). L'UMR est implanté sur le site du CEA Cadarache et sur le Campus de la Faculté des Sciences de Luminy. Les projets de recherche fondamentale du BIAM ont pour objectifs la compréhension des mécanismes impliqués dans la réponse et l’adaptation des organismes vivants aux contraintes environnementales et le développement des technologies dédiées à la préservation de la qualité de notre environnement. Ils sont conduits selon plusieurs approches pluridisciplinaires sur des organismes modèles (algues, plantes, bactéries) ou sur les organismes les plus adaptés à partir d'études de la biodiversité.

Rémunération et avantages

Rémunération

4216,70 € à 4395,65 € bruts mensuels

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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Les métiers de la recherche