Chercheur (H/F) sur l'évaluation des fonctions associées à la séparation de phases chez Nucleocytoviricota H/F

Description du Poste

Les Missions

Évaluation des fonctions associées à la séparation de phases chez Nucleocytoviricota

Le laboratoire IGS propose un poste de post-doctorant. Ce poste a pour objectif d'élucider le métabolisme mitochondrial lors de l'infection par les virus géants chez Acanthamoeba castellanii. Le projet sera réalisé en collaboration avec Diamond Light Source, Oxfordshire, Royaume-Uni, et l'Université de Genève, Genève, Suisse. L'objectif final du projet est de parvenir à une dissection fonctionnelle de la fonction mitochondriale lors de l'infection par Nucleocytoviricota

L'Activité

Le premier objectif du projet sera d'identifier les protéines associées à la dysfonction mitochondriale lors de l'infection virale. La protéomique, la transcriptomique, l'invalidation génique et l'analyse métabolique seront combinées dans ce but.
Deuxièmement, un marquage au carbone et/ou à l'azote sera réalisé afin de permettre le traçage des flux métaboliques.
Enfin, le post-doctorant s'engagera dans l'exploration de données métagénomiques pour analyser la présence de protéines ciblant les mitochondries au sein du phylum Nucleocytoviricota.

Votre Profil

Compétences

- Doctorat en sciences biologiques (entre 2 et 7 ans d'expérience post-doctorale)
- Solide expertise en physiologie et métabolisme mitochondriaux
- Bon niveau d'anglais exigé
- Toute nationalité acceptée

Votre Environnement de Travail

Le laboratoire IGS est pionnier et leader mondial dans l'étude des virus géants dont nous avons découvert les quatre familles connues. Une force unique du laboratoire IGS est la coexistence d'une équipe de biologie computationnelle et d'une équipe de biologie expérimentale, permettant une continuité efficace et transparente depuis l'isolement de nouveaux micro-organismes jusqu'à leur caractérisation complète par la génomique, la transcriptomique, la protéomique et la génétique inverse. Le laboratoire a également la capacité de déterminer la structure 3D de protéines virales d'intérêt spécifique en utilisant la cristallographie aux rayons X seule ou en combinaison avec la microscopie électronique.
Le laboratoire IGS est déjà bien équipé pour la biologie cellulaire (2 salles L2, 6 PSM, 3 microscopes à fluorescence (dont 1 Zeiss Axio), 4 incubateurs), la biochimie (PCR, 1 PSM Microbiologie, 3 incubateurs, 2 Aktä explorer 10S, 1 Aktä 3D, 1 Aktä Prime, Nanodrop, Qubit, spectrophotomètres 96 puits et 1 mL) et biologie structurale (robot de cristallisation Mosquito, diffractomètre maison (diffraction Oxford Xcalibur PXUltra, un speedvac SPD131 ThermoFischer). L'IGS a un accès direct aux 12 plateaux techniques de l'Institut Méditerranéen de Microbiologie (IMM, AMU-CNRS FR3479, Effectifs : 300). Les plateformes d'intérêt pour le projet sont l'imagerie fluorescence/TEM (TEM, Cryo-TEM), RMN (600 MHz, cryosonde), Protéomique. , installation d'expression et d'interactions protéiques (1 Aktä prime, 1 Aktä Pure). La plateforme de production de protéines exploite un système Blitz permettant de cribler et de caractériser rapidement les interactions macromoléculaires. L'IGS dispose également d'un accès permanent aux plateformes d'imagerie du campus de Luminy, dont la microscopie électronique (. TEM et STEM) à l'IBDM (Institut de Biologie du Développement de Marseille). L'IGS maîtrise toutes les compétences requises en biologie cellulaire (microscopie optique, de fluorescence et électronique, purification des virus, infections synchronisées, extraction et études moléculaires), en biologie structurale, en biochimie et en méthodes de virologie. Le laboratoire fait également partie du BAG du synchrotron de Marseille et a accès aux installations européennes de rayonnement synchrotron et de Soleil pour la cristallographie. Le Bag donne également accès gratuitement aux plateformes EM de l'ESRF équipées du microscope cryoélectronique Titan Krios avec détecteur d'électrons direct K2 Summit, d'un filtre d'imagerie Quantum LS et d'une plaque de phase Volta (VPP). Ce microscope fonctionnera comme une ligne de lumière (CM01) au sein du Partenariat pour la biologie structurale (PSB) avec les microscopes situés à l'IBS et à l'EMBL.. Le laboratoire IGS possède toute la puissance de calcul nécessaire (cluster de 71Nodes, 156 CPU, 828 Cores, 4700 Go, 150 To).

Contraintes et risques

Le candidat sélectionné pourra débuter entre le 1er février 2027 et le 1er mai 2027, selon ses disponibilités. Le poste est d'une durée de 18 mois

Rémunération et avantages

Rémunération

entre 3132.83€ brut et 4806.76€ brut selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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