En poursuivant votre navigation sur ce site, vous acceptez le dépôt de cookies dans votre navigateur. (En savoir plus)
Portail > Offres > Offre UMR7256-ESTGRO-020 - Post-doctorant Biochimie H/F

Post-doctorant Biochimie H/F

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : jeudi 13 octobre 2022

Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler. Les informations de votre profil complètent celles associées à chaque candidature. Afin d’augmenter votre visibilité sur notre Portail Emploi et ainsi permettre aux recruteurs de consulter votre profil candidat, vous avez la possibilité de déposer votre CV dans notre CVThèque en un clic !

Informations générales

Référence : UMR7256-ESTGRO-020
Lieu de travail : MARSEILLE 09
Date de publication : jeudi 22 septembre 2022
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2889 et 4082€ bruts mensuels, selon expérience professionnelle
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Le projet proposé vise à élucider comment le génome des Mimiviridae est assemblé dans les capsides icosaédriques. Etant donné que l'ADN désorganisé doit être transféré au travers d'au moins une membrane lipidique et se retrouve compacté dans une structure hélicoïdale de 30nm de section une machinerie spécifique doit être dédiée à ce processus. Le but final de ce projet sera de comparer cette machinerie d'assemblage avec les machineries de translocation d'ADN utilisées dans le monde cellulaire et viral.

Activités

Un premier objectif du projet sera d'extraire et de purifier les membranes des capsides purifiées dans le but d'identifier les protéines membranaires (virale et cellulaire) qui la composent. Des tests d'activité in vitro devront être développés afin d'identifier les fractions pouvant contenir la machinerie d'assemblage. Enfin des protocoles d'extraction devront être développés afin d'étudier ces complexes par microscopie électronique. Les analyses complémentaires de protéomique fourniront des cibles qui pourront être exprimées et purifiées et des méthodologies standard (nanodisques, cristallisation, Cryo-EM) sont utilisées pour résoudre les structures des protéines individuelles et des complexes préassemblés in vitro.

Compétences

Compétences attendues :
- Doctorat en Biologie ou Physique
- Forte expertise en Biologie Structurale et une solide expériences des protéines membranaires: Biochimie, Cryo Microscopie électronique, Cristallographie.Une expérience en biologie cellulaire et/ou virologie est un plus mais n'est pas requise.
Anglais (niveau B1 à B2)

Contexte de travail

La personne recrutée sera rattachée au laboratoire IGS – UMR7256.
Des expériences sur temps long pourront avoir lieu et il faudra adapter le temps de travail à ces contraintes (nocturne, weekend) si nécessaire.
Le laboratoire IGS est un pionnier et un leader mondial dans l'étude des virus géants. Nous avons participé à la découverte de Mimivirus, le premier virus géants et découvert les trois autres familles connues. La force du laboratoire IGS réside dans la coexistence d'une équipe de bioinformaticiens et d'une équipe d'expérimentalistes, permettant d'aller de l'isolement de nouveaux micro-organismes à leur caractérisation complète par la combinaison d'approche incluant la génomique, la transcriptomique et de la protéomique. Le laboratoire a également une expertise forte en biologie structurale permettant de déterminer les structures 3D de protéines virales d'intérêt par cristallographie et en combinant la cristallographie et la microscopie électronique.
Le laboratoroire est équipé pour la biologie cellulaire (1 L2, 6 PSM, 3 microscopes à fluorescence dont 1 Zeiss Axio); la biochimie (PCR, 1 PSM Microbiologie, 3 incubators, 2 Aktä explorer 10S, 1 Aktä 3D, 1 Aktä Prime, Nanodrop, Qubit); la biologie structurale (robot de cristallisation Mosquito, un diffractomètre (Oxford diffraction Xcalibur PXUltra, un speedvac SPD131 ThermoFischer). L'IGS a accés aux 12 plateformes techniques de l'institut de Microbiologie de la Méditerrannée (IMM, AMU-CNRS FR3479, Personnel: 300) dont une plateforme d'imagerie fluorescence et microscopie électronique (TEM, Cryo-TEM), RMN (600 MHz, cryoprobe), Protéomique, Expression de protéines et étude d'interactions (1 Aktä prime, 1 Aktä Pure, 1 BLItz, ITC, Biacore). L'iGS a également accès à la plateforme d'imagerie du campus de Luminy (TEM and STEM) IBDM (Institut de Biologie du Développement de Marseille). L'IGS appartient au BAG SUD et a accès aux synchrotrons (ESRF, Soleil), aux plateformes de microscopie électronique (Titan Krios cryo-electron microscope, K2 Summit direct electron detector, Quantum LS imaging filter and a Volta phase plate VPP). Ces microscopes sur sur la ligne (CM01) (PSB) et à l'IBS et l'EMBL. L'IGS collabore avec le laboratoire de Kay Grünewald laboratory, CSSB (Hambourg) equipé de 5 cryomicroscopes incluant 2 Titan-Krios (300 keV top end, autoloader, DED, energy filter, VPP). L'IGS possède la puissance de calcul nécessaire (cluster de 71Nodes, 156 CPU, 828 Cores, 4700 Go, 150 To).

Informations complémentaires

contrat pouvant être renouvelé de 12mois
CV et lettre de motivation obligatoire + 2 lettres de recommandation

On en parle sur Twitter !