Missions

L'ingénieur consacrera son temps à une nouvelle activité de recherche exploitant le développement de « sources photoniques intelligentes » pour la mise en œuvre de nouvelles techniques d'imagerie multiphotonique.

Ses missions seront:

- Développer et conduire des approches méthodologiques en imagerie photonique (microspectroscopie multiphotonique de fluorescence et vibrationnelle) appliquées à des questions biologiques.

- Fonction support dans la mise en oeuvre et le dévellopement de systèmes d'imagerie photonique innovants au sein d'XLIM dans le cadre du projet ERC STREAMLINE.

Activités

Piloter des expérimentations en microscopie multimodale
- Concevoir un plan d'expérience
- Acquérir des données notamment hyperspectrales
- Organiser la gestion des données générées (banque d'images, sauvegarde)
- Réaliser la métrologie de l'instrumentation

Analyser des données recueillies
- Utiliser des logiciels de visualisation (lmageJ, ... )
- Utiliser de logiciels pour de l'analyse multivariées (Matlab, R, ... )
- Utiliser des approches d'analyse d'images par IA

Préparer des échantillons
- Réaliser des coupes histologiques (sur organes inclus en paraffine ou congelés)
- Réaliser des colorations histologiques et des immunomarquages
- Adapter la préparation de l'échantillon à l'instrumentation utilisée

Conseiller les utilisateurs
- Réaliser la veille technologique et scientifique
- Assister les utilisateurs dans la préparation des échantillons
- Accompagner les utilisateurs dans le traitement des données
- Rédiger des rapports, des notes de synthèse

Compétences

Savoirs :
- Connaissance approfondies en biologie
- Connaissance en microscopie et en analyse d'images
- Connaissances en informatique appliquée à la biologie
- Connaissances en optique ou systèmes photoniques
- Maitriser les analyses statistiques
- Maitriser l'expression orale et écrite en langue anglaise

Savoir-faire :
- Savoir piloter un microscope multimodal combinant microscopie de fluorescence et microspectroscopie vibrationnelle à détection hyperspectrale
- Traiter des données d'imagerie hyperspectrale (ou multidiimensionelle/multiimodale)
- Maitriser les coupes au microtome, les colorations et les immunomarquages de tissus et d'organismes biologiques

Savoir-être:
- Capacité à travailler en autonomie (sens de l'organisation, polyvalence, adaptabilité) aussi bien qu'en équipe (sens relationnel)
- Capacité de travailler dans un environnement transdisciplinaire et d'interagir avec des spécialistes d'autres disciplines scientifiques que la sienne (curiosité scientifique, ouverture d'esprit)

Contexte de travail

Le candidat retenu intégrera l'Institut de Recherche Xlim sur le site géographique de Limoges (France), ville de 130 000 habitants au cœur de la Région Nouvelle-Aquitaine reconnue pour sa qualité de vie. Xlim est une unité mixte de recherche multidisciplinaire (UMR - CNRS 7252), en association avec le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). L'Institut rassemble plus de 500 universitaires, chercheurs, personnels techniques et doctorants avec des expertises couvrant de vastes domaines de l'électronique et des micro-ondes, de l'optique et de la photonique, des mathématiques, de l'informatique et du traitement d'image.

L'ingénieur sélectionné rejoindra le Département Photonique de Xlim. Il mènera des recherches à l'interface de l'équipe PhoCal (Sources laser & Contrôle cohérent) et de l'équipe BioPhot (Biophotonique & Imagerie) dans le cadre d'un projet ERC Starting Grant (STREAMLINE – 2021-2026). Le candidat intégrera un groupe international et dynamique qui comprendra plusieurs postdocs et doctorants travaillant conjointement sur le projet pendant toute la durée de la thèse.

 Plus d'informations sur les dernières activités de recherche ici : www.smartphotonics.net
 Plus d'informations sur le projet STREAMLINE ici : www.streamline-project.com


Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

• Le laboratoire est équipé de lasers femtosecondes (Classe 3) pour lesquels des protections adaptées sont prévues.

Risques physiques:
- Ambiance de travail bruyante
- Rayonnements Laser*

Risques liés à l’environnement de travail:
- Travail sur écran
- Multiples lieux de travail
- Déplacements/Missions

Risques chimiques:
- Agent Chimique Dangereux

Risques biologiques:
- Agents biologiques Groupe 2
- Agents biologiques Groupe 3
- Echantillons humains / animaux