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Scientifique Responsable des Données (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : mardi 7 février 2023

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Informations générales

Référence : UMR7093-MADWAL-002
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : VILLEFRANCHE SUR MER
Date de publication : mardi 17 janvier 2023
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 avril 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2609 et 3303 €
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Le/La Scientifique Responsable des Données (Chief Data Scientist) d'AO-EMBRC assurera plusieurs missions relatives à la gestion des données multi-modales collectées (génomique, diversité, imagerie, physico-chimique, etc), leur recensement, leur intégration dans les processus d'analyses, leur interopérabilité avec les bases de données de références existantes et leur mise à disposition pour le public (scientifique ou général).

Activités

-Participer à la définition du plan d'étude et de recueil des données le mieux adapté au problème posé
-Concevoir et élaborer les systèmes et outils d'information permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les données
-Étudier et mettre en place les meilleures solutions techniques pour gérer les grands volumes de données et suivant les principes F.A.I.R. et directives institutionnelles
-Animer des ateliers d'expression des besoins internes
-Rédiger la spécification des besoins
-Participer à la diffusion et valorisation des résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales
-Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de l'analyse des données biologiques
-Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité
-Animer des réseaux professionnels d'échange de compétences
-Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en œuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultats

Compétences

Connaissances :

-Recueil, analyse et traitement des données (génomique et/ou biodiversité et/ou imagerie et/ou physico/chimique d'échantillonnage)
-Maîtriser les outils et concepts lié à la gestion, l'interopérabilité et à l'ouverture de données multimodale
-Maîtrise d'un langage de programmation ou de traitement de donnée (Perl/Python, R) en environnement Unix/Linux
-Environnement et réseaux professionnels
-Culture du domaine
-Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Compétences opérationnelles :

-Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
-Mettre en œuvre une démarche qualité
-Concevoir des outils pédagogiques et de communication

Facteurs d'évolution à moyen terme :

-Complexification des données à traiter et des outils d'analyse
-Développement des moyens et méthodes d'accès aux données, de présentation et de visualisation

Impact sur l'emploi-type :

-Veille technique sur l'évolution des outils d'analyse
-Diversification des types de données collectées et interopérées

Contexte de travail

Au sein de Sorbonne Université, le Centre National de Ressources Biologiques Marines (EMBRC-France) est une infrastructure de recherche (IR) nationale en biologie et écologie marines, lauréate du Programme Investissements d'Avenir (PIA) et portée par Sorbonne Université et le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). Elle implique les trois stations marines sous tutelle de Sorbonne Université et du CNRS, sur les sites de Roscoff , Banyuls-sur-Mer , et Villefranche-sur-Mer . Cette infrastructure nationale constitue le nœud français de l'ERIC EMBRC, infrastructure européenne de recherche en biologie et écologie marines, dont le siège est situé à Sorbonne Université.

EMBRC-France a pour missions de soutenir la recherche sur les organismes et les écosystèmes marins, et de favoriser leur exploration et leur exploitation durables. Les champs scientifiques d'EMBRC-France sont la biologie marine, l'écologie marine et l'océanographie biologique.

Le projet « Observatoires Augmentés du Centre National de Ressources Biologiques Marines », AO-EMBRC, vise à établir des observatoires augmentés de biologie marine en France, afin de mener des études de suivi temporel de plusieurs sites.

Le/La Scientifique Responsable des Données (Chief Data Scientist) sera localisé à l'IMEV, au Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV), avec de fortes interactions avec les autres stations de biologie marine (Banyuls et Roscoff) ainsi qu'avec le CEA / Genoscope à Evry.

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