Missions

L'ingénieur rassemblera, à partir de bases de données publiques, de flores, ou de la littérature scientifique, des données sur des traits reproducteurs et végétatifs chez les plantes à fleurs et organisera ces données sous format standardisé. Il/elle participera à la curation des données préexistantes déjà récoltées et à la préparation des données pour les analyses du projet.

Activités

1) Recherche des données, leur organisation et la mise à disposition pour des personnes impliquées dans le projet. 2) Curation des données déjà disponibles et nouvellement acquises 3) Préparation des métadonnées associées 4) Préparation des données pour les analyses en associations avec les autres données du projet (ex : phylogénies, données génomiques) 4) Organisation transparente et reproductible des protocoles. 5) Communication (écrite et orale, en anglais et/ou français) auprès des partenaires impliqués dans le projet et pour la communauté scientifique.

Compétences

Une familiarité avec la botanique et une formation en biologie évolutive et écologie sont indispensables. Une expérience avec l’utilisation de bases de données et l’utilisation de scripts simples (typiquement sous R) pour la manipulation de fichiers de données seraient un plus. La personne doit pouvoir faire preuve de rigueur dans son travail (organisation des données, des protocoles de collecte, de curation, de préparation des données) et doit être capable de bien communiquer avec les autres membres du projet pour permettre un véritable travail en équipe. Un bon niveau en anglais serait appréciable, en particulier à l’écrit (rédaction de protocoles, de fiches de métadonnées, littérature en anglais).

Contexte de travail

Le poste s'inscrit dans le projet ANR FloweRS (Déterminants reproductifs du succès évolutif et écologique chez les plantes à fleurs). La personne sera basée à ECOBIO au sein du thème EVO-ADAPT et travaillera étroitement avec Sylvain Glémin mais interagira également avec Cendrine Mony, Aude Ernoult, Simon Chollet et Vincent Jung du thème PAYSABIO. En dehors du laboratoire, elle interagira en particulier avec Jos Käfer (ISEM, Montpellier) et Hervé Sauquet (Jardin botanique de Sydney, Australie), partenaires du projet. Sur des aspects techniques des bases de données, la personne recrutée pourra compter sur la collaboration avec des chercheurs et ingénieurs en informatique (équipes d'Eric Tannier, LBBE Lyon et de Simon Castellan, INRIA Rennes).

Contraintes et risques

Travail sur écran. Déplacements occasionnels possibles à Montpellier et à Lyon pour rencontrer les collaborateurs du projet.