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Portail > Offres > Offre UMR6553-SYLGLE-001 - Ingénieur bio-informatique/bio-analyse (H/F)

Ingénieur bio-informatique/bio-analyse (H/F)


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Informations générales

Référence : UMR6553-SYLGLE-001
Lieu de travail : RENNES
Date de publication : mardi 3 septembre 2019
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 25 novembre 2019
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2000 et 2200€ bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

La personne recrutée travaillera dans le cadre du projet ANR GENASEX dont l'objectif est d'étudier l'évolution et les conséquences génomiques de l'asexualité chez deux groupes d'arthropodes, Artémies et Daphnies. La personne recrutée aura en charge le traitement bioinformatique des données génomiques générées dans le projet. Dans un premier temps elle prendra en charge l'assemblage et l'annotation du génome d'Artemia parthenogenetica. Dans un deuxième temps, elle participera au traitement et à l'analyse des données de transcriptomique (RNAseq) qui seront utilisées pour le génotypage et l'étude de l'expression des gènes.

Activités

- Gestion et traitement des données de séquençage générées dans le projet (nettoyage, mise en forme, archivage,…)
- Assemblage de génome
- Annotation de génome
- Mapping
- Recherche de variants (SNPs, Indels)
- Analyse d'expression

Compétences

- Outils standards de bioinformatique pour la génomique
- Programmation : bash, R, python
- Traitement des données d'expression (RNAseq)
- Biostatistique pour le traitement des données génomiques
- Travail en équipe
- Anglais

Contexte de travail

La personne recrutée travaillera au sein de l'équipe “Génome, Evolution, Adaptation” au sein de l'UMR 6553 ECOBIO sous la responsabilité de Sylvain Glémin (DR CNRS), partenaire du projet ANR GENASEX. Elle travaillera en partie avec les outils et le support de la plateforme biogenouest.

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