Missions

La personne recrutée secondera la porteuse du projet européen MICRORESCUE dans l'encadrement des doctorants et personnels techniques impliqués dans le projet, participera aux expérimentations de terrain et de laboratoire. Le CDD est proposé pour 2 an renouvelable.

Activités

Organisation et coordination des activités des doctorants et personnels techniques
Supervision du développement des protocoles en microbiologie et biologie moléculaire
Participation aux expérimentations de terrain et à la mise en place des mésocosmes

Compétences

Expérience de recherche en microbiologie et/ou écologie microbienne des écosystèmes terrestres (sol et plante)
• Maitrise des outils de microbiologie standard et de biologie moléculaire (extraction d'acides nucléiques, qPCR, metabarcoding / metagénomique)
• Excellentes aptitudes organisationnelles pour les activités de recherche : optimisation des protocoles expérimentaux, compilation et gestion des données,
• Aptitudes à générer des données fiables et de bonne qualité ; intégrité scientifique
• Activités de gestion d'équipe ou de projet, notamment d'organisation et de coordination
• Expérience de la collecte d'échantillons, de la réception, de la manipulation et du traitement microbiologique des sols
• Capacité à travailler en autonomie et adaptabilité
• Capacité à travailler en étroite collaboration avec le porteur de projet pour le respect des délais et des résultats attendus.
• Capacité à résoudre les problèmes de manière proactive et à trouver des solutions
• Capacité à travailler en harmonie au sein d'une équipe, y compris avec des étudiants.
• Maîtrise du français et de l'anglais avec d'excellentes aptitudes à la communication orale et écrite.
Compétences ou expériences supplémentaires
• Aptitude à travailler dans un environnement de recherche français
• Optimisation de protocoles ou le développement de nouveaux protocoles
• Maitrise des approches et de la conception d'expérimentation en mésocosmes
• Participation au réseau international de recherche écologique à long terme ou d'un réseau similaire pour l'écologie
• Travaux sur les Firmicutes (bacilles) (endo)sporulés et/ou les Actinomycètes (culture, biologie moléculaire ou autre)
• Connaissance des normes de la science ouverte pour la recherche y compris la reproductibilité et le dépôt de données publiques, et engagement en faveur de ces normes.

Contexte de travail

Le Laboratoire d'Écologie Microbienne (LEM) du CNRS à Lyon est un centre de recherche de renommée mondiale, où la passion pour la science et l'innovation se rencontrent. Notre laboratoire se consacre à l'étude des interactions complexes entre les micro-organismes et leur environnement.
Au LEM, nous explorons les mécanismes fondamentaux des interactions microbiennes, de l'échelle moléculaire à celle de l'écosystème. Nos travaux ont un impact direct sur des problématiques cruciales telles que le changement climatique, la résistance aux antibiotiques, et la bioremédiation des sols et des eaux.

Contraintes et risques

Déplacements possibles pour la collecte d'échantillons sur le terrain ou pour assister à des réunions scientifiques afin de valoriser les résultats.