Chercheur Postdoctoral (H/F)

Description du Poste

Les Missions

• Mettre en place et optimiser des tâches comportementales auditives Go/NoGo et FlexCat chez la souris tête-fixée
• Réaliser des enregistrements Neuropixels aigus simultanés dans le cortex auditif et les sous-régions préfrontales
• Effectuer des injections virales stéréotaxiques, des expériences de perturbation optogénétique et les traitements histologiques associés (clarification tissulaire CUBIC, récupération des trajectoires de sondes, recalage dans l'Atlas Allen)
• Analyser de larges jeux de données neuronales à l'aide de pipelines de tri de spikes (SpikeInterface / Kilosort) et de méthodes de décodage de population (SVM, régression logistique, analyse en composantes tensorielles)
• Contribuer à l'intégration et à la calibration du système de stimulation AudioSphere
• Co-encadrer des étudiants en thèse et en master et contribuer à la vie scientifique quotidienne du laboratoire
• Rédiger des articles scientifiques et présenter les résultats lors de conférences internationales

L'Activité

L'équipe est nouvellement créée au CRNL, financée par une bourse ATIP-Avenir 2025, le CNRS et la Fondation pour l'Audition. Nous étudions les mécanismes de circuits neuronaux sous-tendant la catégorisation auditive — l'une des opérations cognitives fondamentales reliant la perception sensorielle à la connaissance abstraite et à l'action. Notre approche combine l'électrophysiologie haute densité Neuropixels, l'optogénétique et des paradigmes comportementaux novateurs chez la souris tête-fixée, articulés autour de trois programmes de recherche complémentaires :

• WP1. Déterminer les catégories auditives spatiales que les souris sont capables de rapporter (élévation, distance, mouvement), à l'aide du système de stimulation spatialisée AudioSphere.
• WP2. Caractériser les circuits neuronaux sous-tendant la catégorisation auditive flexible, par des enregistrements simultanés des cortex auditif et préfrontal durant la tâche FlexCat.
• WP3. Établir la dimension émotionnelle de la catégorisation des sons naturels, en combinant monitoring physiologique, suivi des expressions faciales et enregistrements Neuropixels lors de stimulations auditives naturalistes.

Le/la postdoctorant(e) jouera un rôle central dans les WP1 et WP2, en supervisant l'entraînement comportemental, les enregistrements électrophysiologiques, les expériences de perturbation optogénétique, les expériences de traçage viral et l'analyse de données à grande échelle.

Votre Profil

Compétences

Qualifications requises

• Doctorat en neurosciences, bioingénierie ou dans un domaine proche
• Expérience pratique dans au moins l'un des domaines suivants : électrophysiologie in vivo (sondes silicium ou tétrodes), entraînement comportemental de rongeurs, ou optogénétique
• Solides compétences en programmation (Python, Julia ou MATLAB) pour l'analyse de données
• Capacité à mener un projet expérimental de façon autonome
• Bonne maîtrise de l'anglais oral et écrit

Compétences appréciées

• Expérience avec les sondes Neuropixels et le tri de spikes (Kilosort, SpikeInterface)
• Maîtrise des injections de vecteurs viraux et de l'histologie cérébrale chez le rongeur
• Expérience des méthodes d'apprentissage automatique pour le décodage neuronal
• Connaissance des paradigmes comportementaux auditifs ou de la théorie de détection du signal
• Publications dans des revues à comité de lecture

Votre Environnement de Travail

Ce que nous offrons

• Un environnement stimulant et collaboratif à l'interface des neurosciences systémiques, de la bioacoustique et de l'éthologie
• Un équipement de pointe : sondes Neuropixels 1.0 et 2.0, vidéographie haute vitesse, plateformes d'optogénétique, microscopie confocale, et le système de stimulation acoustique 3D AudioSphere
• Une formation directe par le PI sur tous les aspects du projet (comportement, électrophysiologie, analyse, rédaction scientifique)
• Accès aux clusters de calcul haute performance (GPU) et à l'infrastructure de gestion des données du CRNL
• Un écosystème scientifique riche avec des experts locaux en tri de spikes (Samuel Garcia, équipe SpikeInterface) et en neurosciences des circuits (équipe FORGETTING, CRNL)
• Collaboration externe avec le Laboratoire de Mécanique et d'Acoustique (LMA, Marseille) pour le développement de l'AudioSphere
• Soutien pour la participation à des conférences et opportunités de développement de carrière
• Financement sécurisé de 2 ans via la bourse ATIP-Avenir, avec possibilités de prolongation

Environnement de travail

Le laboratoire est intégré au CRNL (Lyon), un institut majeur de neurosciences regroupant plus de 25 équipes de recherche couvrant les processus cellulaires, l'électrophysiologie, le comportement et les neurosciences computationnelles. Au-delà du CRNL, Lyon abrite une communauté neuroscientifique dynamique avec des experts en cognition et en éthologie. L'institut offre l'accès à des ateliers centraux, des plateformes d'imagerie (microscopie confocale, clarification tissulaire), un animalerie et une infrastructure informatique. Lyon est une ville de renommée internationale, offrant une excellente qualité de vie, une scène culturelle riche et des liaisons de transport exceptionnelles (TGV, aéroport international).

Contraintes et risques

Ce poste s'adresse à un(e) candidat(e) motivé(e) par un environnement de recherche exigeant et multidisciplinaire. Le projet implique une courbe d'apprentissage technique significative, notamment pour la maîtrise simultanée des enregistrements Neuropixels multi-sondes, des protocoles comportementaux auditifs et des manipulations optogénétiques. L'AudioSphere étant un système en cours de développement, une partie du travail expérimental dépendra de sa mise en service dans les délais prévus ; des solutions de repli sont néanmoins prévues pour garantir la continuité scientifique. Enfin, comme dans tout projet impliquant l'entraînement comportemental de rongeurs, les délais d'acquisition des données peuvent varier selon les performances individuelles des animaux. Ces défis font partie intégrante de la recherche fondamentale à haut risque / haute valeur ajoutée et seront abordés collectivement au sein de l'équipe.

Rémunération et avantages

Rémunération

A partir de 3 071€ brut mensuel selon expérience.

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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