Missions

Le candidat (H/F) est recruté dans le cadre d’un projet financé par l’ANR mené en collaboration avec un laboratoire de l’université de Strasbourg. Le projet vise à comprendre les mécanismes moléculaires de la ciliogenèse en général et dans le contexte spécifique des photorécepteurs.
Les cils sont des organelles microtubulaires minuscules présents à la surface de la majorité des cellules chez les mammifères. L’altération de leur formation, stabilité ou fonctionnement causent des pathologies rares, les ciliopathies. Celles-ci sont associées à un large éventail de symptômes et beaucoup partagent des anomalies des photorécepteurs (PR) conduisant à une dégénérescence rétinienne. L'homéostasie des PR repose sur l'assemblage et le fonctionnement corrects de leurs cils, mais de nombreux mécanismes différents ont été impliqués dans la dégénérescence rétinienne associée aux ciliopathies.
Le projet a pour objectifs 1- d’identifier de nouveaux acteurs de l’homeostasie ciliaire par des approches biochimiques et protéomiques sur des cellules mammifères et 2- d’étudier les mécanismes moléculaires de la ciliogenèse impliquant protéines identifiées dans des cellules en culture et dans le contexte des PR en combinant des tests fonctionnels et des approches basées sur la microscopie, notamment la microscopie à expansion à haute résolution (U-ExM).

Activités

Tâches principales
- À l'aide d'approches biochimiques et protéomiques, identifier les protéines associées aux centrioles/cils (générer le protéome des centrioles - approches par capture ou gradient de saccharose ; immunoprécipitation ; dissection moléculaire des interactions protéine-protéine)
- Appliquer des approches de biologie moléculaire, de biologie cellulaire et d'imagerie pour étudier les rôles des protéines identifiées dans la ciliogenèse (culture cellulaire, rétine de souris).
Tâches secondaires
- Encadrer des étudiants en master
- Collaborer et discuter collectivement des résultats avec les membres de l'équipe et avec l'équipe partenaire de l'ANR
- Communiquer les résultats de la recherche (séminaires, publications)

Compétences

- Doctorat en biologie cellulaire ou biochimie
- Solide expérience en biochimie et en protéomique
- Expérience en analyse protéomique
- Une expérience en microscopie est un plus. Si ce n'est pas le cas, la volonté d'acquérir une expertise dans les approches microscopiques est obligatoire

Contexte de travail

Le projet se déroulera au sein de l'unité MeLiS (Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS 5284 INSERM 1314) dans l'équipe du Pr Bénédicte Durand sous la supervision du Dr Véronique Morel, porteuse de l'ANR. L’équipe étudie les processus moléculaires de la ciliogenèse, en utilisant comme système modèles la drosophile et les cellules en culture, et en développant des approches de génétique, biologie moléculaire et microscopie. Les projets reposent sur une grande expertise en microscopie d’expansion, une technique novatrice de préparation des tissus permettant des observations de super-résolution avec des microscopes conventionaux, tant en cellules qu’en tissus épais. (https://www.inmg.fr/melis/en/team_durand.php).
Les équipes de l’unité MeLiS (https://www.inmg.fr/melis/en/melis.php) s'intéressent aux mécanismes moléculaires à l'œuvre dans divers compartiments cellulaires, des cils, membranes et axones aux synapses et circuits, en mettant l'accent sur les cellules neuronales et musculaires. Elles étudient divers processus biologiques et leurs altérations dans les maladies humaines affectant les organismes en développement, adultes et vieillissants au moyen d’un large éventail de modèles (drosophile, C. elegans, poisson zèbre, poulet, souris et humain) et d'approches, notamment la génétique, les analyses moléculaires à grande échelle, les manipulations in vivo, les tests comportementaux, et de nombreuse techniques de microscopie (microscopie à super-résolution, microscopie d'expansion, 2 photons in vivo, microscopie à feuillet de lumière, microscopie électronique).
MeliS est un environnement très dynamique et vivant, avec un club de jeunes chercheurs très actif et une équipe Greenlab. Il est situé dans les bâtiments de la Faculté de médecine, dans la ville de Lyon, très bien desservi par les transports en commun.

Contraintes et risques

aucune