Ingénieur H/F en Bioinformatique

Nouveau

Mécanismes en sciences intégratives du vivant

LYON 08 • Rhône

  • IT en contrat CDD
  • 6 mois
  • BAC+3/4

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Mécanismes en sciences intégratives du vivant

Type de Contrat

IT en contrat CDD

Temps de Travail

Complet

Lieu de Travail

69008 LYON 08

Durée du contrat

6 mois

Date d'Embauche

01/12/2026

Rémuneration

A partir de 2521€ brut selon expérience

Postuler Date limite de candidature : lundi 16 novembre 2026 23:59

Description du Poste

Les Missions

Nous recrutons un·e ingénieure / ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nucleus RNA-seq générées à partir d’un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d’émergence au sein d’un embryon aviaire.

L'Activité

Les missions principales incluront :
• Analyse et traitement des données single-nucleus.
• Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients humaines publiques ou des nouvelles données issues de collaborations.
• Application de méthodes bio-informatiques pour l’annotation cellulaire, l’identification de sous-populations, l’analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d’enrichissement en processus biologiques etc.
• Collaboration étroite avec les biologistes de l’équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses.
• Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité.
• Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques.

Votre Profil

Compétences

• Formation : Un Master ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, biostatistiques sera un atout. Une expérience confirmée en analyse de données single-cell ou single-nucleus est indispensable.
• Compétences techniques :
Expérience en programmation (R, Python) et en gestion de données. Maîtrise des outils d'analyse single-cell (Seurat, CellChat, GSEA etc.).
• Qualités personnelles :
Rigueur, autonomie et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire.

Votre Environnement de Travail

• Contrat CDD de 6 mois renouvelable 6 mois

L'Ingénieur H/F sera intégré à une équipe comprenant 1 ingénieur Bio-informaticien, et sera environné d'autres expertises en analyse de données. L'unité est située au coeur du campus de Lyon-Est à proximité des transports en commun.

Rémunération et avantages

Rémunération

A partir de 2521€ brut selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR5284-VALCAS-011
Secteur d’activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

Le CNRS

Les métiers de la recherche

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Ingénieur H/F en Bioinformatique

IT en contrat CDD • 6 mois • BAC+3/4 • LYON 08

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