Chercheur postdoctoral en biologie cellulaire / biophysique (H/F)

Description du Poste

Les Missions

Le groupe « Développements méthodologiques en AFM pour la biologie » au CBMN (Bordeaux) recherche actuellement un chercheur postdoctoral spécialisé dans la caractérisation structurale, mécanique, dynamique et fonctionnelle de cellules en interaction avec des assemblages peptidiques bactériens. Il s'agit d'un projet interdisciplinaire à la frontière entre biologie cellulaire / structurale et biophysique, financé par une ERC StG 2024, et combinant notamment microscopie à force atomique, et microscopie à fluorescence et confocale avancée.

Contexte du projet. Staphylococcus aureus, pathogène opportuniste et résistant à nombre d’antibiotiques, s’appuie notamment sur un arsenal de facteurs de virulence pour coloniser l’hôte et provoquer l’infection. Parmi eux, les phenol soluble modulins (PSMs) constituent une famille de peptides amphiphiles jouant un rôle clé dans (i) la structuration et la maturation des biofilms, (ii) la lyse des cellules hôtes par perturbation membranaire, et (iii) l’activation de la réponse inflammatoire via des récepteurs membranaires spécifiques. Outre leurs fonctions biologiques, les PSMs présentent une forte propension à l’auto-assemblage en fibrilles amyloïdes aux architectures variées, potentiellement liées à leurs activités cytotoxiques et/ou pro-inflammatoire. Toutefois, les mécanismes moléculaires sous-tendant les fonctions des PSMs restent à ce jour largement incompris.

Objectif du projet. Nous souhaitons comprendre comment les propriétés physico-chimiques et la dynamique d’auto-assemblage des PSMs gouvernent leurs interactions avec les membranes cellulaires - tant au niveau des lipides que des récepteurs - et, in fine, contrôlent la mort cellulaire et la réponse inflammatoire de l’hôte, via le récepteur couplé aux protéines G, FPR2. Pour ce faire, le projet adoptera une approche in cellulo et multi-échelle, allant de la cellule vivante à la molécule unique, afin d’identifier les déterminants structuraux, physico-chimiques et dynamiques impliqués.
Les travaux s’articuleront autour de deux axes méthodologiques complémentaires :
1. Lien entre interactions peptide–membrane et cytotoxicité (cellules HEK), combinant tests de viabilité, microscopie de fluorescence (confocal, TIRF) et microscopie à force atomique (AFM) en conditions physiologiques, pour suivre en temps réel les altérations morphologiques et mécaniques induites par différents assemblages de PSMs.
2. Étude quantitative des interactions PSMs–FPR2, reposant sur l’ingénierie cellulaire (expression transitoire de récepteurs) et la reconstitution de membranes complexes (protéoliposomes, bicouches supportées). Le mécanisme de reconnaissance sera analysé à l’échelle moléculaire par spectroscopie de force à molécule unique (AFM), et couplé à l’exploration des voies de signalisation activées, à l’aide d’approches de transfert d'énergie par résonance de bioluminescence (BRET) et fluorescence (FRET).

Ce projet mobilise des compétences en biophysique des membranes, biologie cellulaire, et imagerie avancée, de l’échelle cellulaire à l’échelle moléculaire. Ce projet est intentionnellement ouvert ; selon les expertises et intérêts du candidat, le projet pourra être orienté plus spécifiquement vers les interactions peptide–lipides, les mécanismes de reconnaissance par les récepteurs, ou le développement d’approches biophysiques avancées, offrant ainsi une grande liberté scientifique et un fort potentiel de valorisation.

L'Activité

• Culture cellulaire (cellules de mammifère HEK, bactéries)
• Méthodes biophysiques de caractérisation des peptides et protéines membranaires
• Microscopies de fluorescence : confocal, TIRF
• Spectroscopie de force - Microscopie à force atomique
• Analyse, mise en forme et présentation de résultats

Votre Profil

Compétences

• Connaissances en biologie cellulaire
• Expériences avec les lipides et/ou récepteurs couplés aux protéines G
• Expertise en microscopies de fluorescence
• Expertise en microscopie à force atomique
• Connaissance des techniques biophysiques appliquées aux peptides / protéines
• Manipulation de produits chimiques et biologiques
• Maitrise de l’anglais
• Rédaction et communications orales
• Autonomie et esprit d’équipe

Votre Environnement de Travail

Le projet est intentionnellement ouvert ; selon les expertises et intérêts du candidat, le projet pourra être orienté plus spécifiquement vers les interactions peptide–lipides, les mécanismes de reconnaissance par les récepteurs, ou le développement d’approches biophysiques avancées, offrant ainsi une grande liberté scientifique et un fort potentiel de valorisation.

Le projet se déroulera sous la supervision de Marion Mathelié-Guinlet à l’Institut de Chimie et Biologie des Membranes et des Nano-Objets (CBMN) à l’Université de Bordeaux, dans le cadre de son ERC Starting Grant PUMBA. Ce financement assurera l’environnement du projet, et l’extension éventuelle du contrat postdoctoral. Le post-doctorant aura accès aux installations de pointe du CBMN pour l’analyse structurale, et nanomécanique de systèmes biologiques et l’imagerie corrélative. Le CBMN offre, de plus, un environnement dynamique et stimulant pour relever des défis majeurs dans le domaine des interactions peptide-membrane, grâce au réseau collaboratif d’experts en biologie cellulaire/moléculaire, en physico-chimie et en développements méthodologiques de pointe.

Rémunération et avantages

Rémunération

Entre 3 041€ à 3 467€ bruts mensuels selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

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