Missions

Ce projet qui a reçu un financement de prématuration du CNRS vise à accélérer le développement de nouvelles classes de composés antibiotiques ciblant l’anneau de processivité bactérien ou anneau β. L'OMS a identifié les pathogènes ESKAPE (E. faecium, S. aureus, K. pneumoniae, A. baumannii, P. aeruginosa et Enterobacter spp.) comme cibles prioritaires pour la recherche de nouveaux antibiotiques. Ces pathogènes sont la principale cause d'infections nosocomiales et nombre d'entre eux sont résistants aux antibiotiques actuels. Ces dernières années, dans le but d’inhiber la réplication de l’ADN chez les bactéries à Gram négatif, nous avons élaboré des molécules peptidiques capables de bloquer efficacement le site d’interaction de l’anneau β bactérien. Cette protéine est utilisée comme plateforme d’ancrage des ADN polymérases (enzymes responsables de la réplication de l’ADN) et permet de maintenir ces dernières au contact de l’ADN ce qui leur procure une très grande processivité. Cette protéine est donc essentielle à la survie des bactéries. L'objectif de ce projet est de synthétiser de manière rationnelle, sur la base de données biophysiques et structurales, des analogues optimisés de ces peptides en utilisant une approche récemment mise au point dans le groupe permettant d’augmenter leur activité antibactérienne. Les meilleurs candidats sélectionnés pour leur activité sur un panel élargi de bactéries seront testés dans un modèle animal d’infection bactérienne

Activités

- Chimie organique, synthèse multi-étape en solution et sur support solide
- Synthèse peptidique
- Techniques classiques de purification et d'analyse des molécules organiques
- Rédactions de rapports et drafts de publications
- Présentations orales en séminaires de groupe

Compétences

Thèse en chimie organique (moins de 3 ans) avec expertise souhaitée dans le domaine de la chimie bio-organique et chimie médicinale.
Nous recherchons des candidats motivés avec un parcours solide. Une bonne maitrise de l'anglais sera un plus de même que des capacités rédactionnelles et de présentation.
Autonome et rigoureux, ouvert au travail en équipe et à des environnements de travail différents (missions possibles en collaboration) et également très motivé pour produire rapidement les molécules à évaluer.

Contexte de travail

Ce projet qui combine chimie organique et chimie des peptides sera réalisé principalement dans le groupe de Gilles Guichard à l’Institut de Chimie et Biologie des Membranes et Nanoobjets (CBMN) au sein de l'Institut Européen de Chimie et Biologie (IECB). CBMN and IECB sont des centres de recherche dynamiques et interdisciplinaires situés sur le campus de l'Université de Bordeaux, France. Le laboratoire est parfaitement équipé pour la synthèse chimique et l'institut est doté de plateformes technologiques associant une instrumentation de pointe dans le domaine de l'analyse physicochimique (RMN, spectrométrie de masse, diffraction des rayons X,...)
La prématuration est la première étape du processus de transfert d’une technologie. Ce projet est réalisé en collaboration étroite avec l’équipe Structure, dynamique et ciblage des machines biomoléculaires à l’Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire de Strasbourg.

Contraintes et risques

Contrainte Hygiène et Sécurité reliée à la manipulation de produits chimiques. Les expériences de synthèse chimique seront réalisées dans le laboratoire du PI à l'IECB dans un laboratoire équipé et fonctionnel en termes de hottes.