Missions

À l'intérieur des cellules, l'ADN est conditionné dans une structure semblable à un polymère appelée chromatine. Caractériser la manière dont la chromatine s'auto-organise est l'un des principaux défis auxquels la biologie est confrontée depuis quelques années. Au cours de la dernière décennie, grâce au développement de techniques expérimentales avancées, des progrès majeurs ont été réalisés dans notre compréhension de l'organisation multi-échelle des chromosomes. De plus en plus de preuves suggèrent que l'organisation spatio-temporelle du génome joue un rôle décisif dans la régulation de l'expression génétique et dans les maladies. En particulier, le mauvais repliement des chromosomes pourrait participer à la dérégulation transcriptionnelle, à des trajectoires cellulaires anormales au cours du développement et, à terme, au cancer.

Activités

Le candidat développera une activité de recherche sur la modélisation du repliement des chromosomes en associant la modélisation des polymères à l’IA. Cela impliquera le développement de modèles biophysiques originaux, de schémas de simulation efficaces et d'outils d'apprentissage automatique/d'intelligence artificielle pour analyser les données. Le candidat collaborera avec des groupes de biologie expérimentale du PEPR Cell-ID qui travaillent à la compréhension du dérèglement du destin cellulaire dans les cancers pédiatriques du cerveau.

Compétences

Nous recherchons un candidat créatif et très motivé avec une formation en physique statistique ou physique des polymères ou en biologie computationnelle. Des compétences avancées en programmation sont requises et une expérience interdisciplinaire antérieure en lien avec des questions biologiques serait un plus.

Contexte de travail

Le candidat intégrera l'équipe « Biologie physique de la chromatine », qui se consacre principalement à la compréhension des bases fondamentales de la chromatine et de la régulation génétique à l'aide de modélisations biophysiques et d'approches computationnelles dans un environnement interdisciplinaire solide. Le groupe fait partie du Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule, qui vise à caractériser les bases moléculaires sous-jacentes à l'organisation et au fonctionnement des processus cellulaires dans des conditions normales et pathologiques. Il est basé à l'École normale supérieure de Lyon, un institut français de recherche et d'enseignement de premier plan.

Ce projet s'inscrit dans le cadre du programme national PEPR Cell-ID, financé par l'Agence nationale de la recherche française. Cell-ID rassemble un consortium multidisciplinaire de laboratoires issus de domaines allant de la biophysique à la biologie du développement et à la médecine clinique autour d'un objectif commun : comprendre comment les cellules acquièrent et conservent leur identité au cours du développement et pourquoi certaines s'écartent de leur trajectoire normale pour donner naissance à des pathologies telles que les tumeurs cérébrales pédiatriques.

Les avantages attachés à cette collaboration :
• Un environnement de travail interdisciplinaire stimulant aux contacts des personnels de la recherche
• Un accompagnement professionnel avec des formations.
• Un restaurant d'entreprise qui permet de bien déjeuner à un prix intéressant.
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%) ou forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
• Un site accessible en transport en commun (Métro + Trams + bus) et vélo


Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

R.A.S.