Post-Doctorat en biologie structurale – H/F

Description du Poste

Les Missions

L'objectif de ce projet est de résoudre les relations structure/activité de la fixation des Lpp à la paroi cellulaire bactérienne par les transpeptidases LdtA,B,C. Les cellules qui en sont dépourvues présentent une plus grande perméabilité de la membrane et une plus grande sensibilité aux antibiotiques en raison d'une perméabilité accrue de leur membrane externe. Par conséquent, le ciblage de la fixation de la Lpp à la couche de peptidoglycane devrait permettre d'éliminer les bactéries chez les patients.

L'Activité

1. Réaliser des travaux de recherche, de la conception expérimentale à la rédaction des résultats :
• Déterminer la structure des différentes L,D-transpeptidases (Ldt) par RMN et/ou cristallographie aux rayons X, seules et en complexe avec leurs partenaires.
• Caractériser les interactions Ldt / peptidoglycane / Lpp à l'échelle structurale, en identifiant les surfaces et résidus impliqués dans la reconnaissance.
• Mettre en œuvre des approches biochimiques et biophysiques complémentaires (mesures d'affinité, cinétique, stœchiométrie) afin de préciser les déterminants de ces interactions.
• Valider in vivo les observations structurales et biochimiques, notamment par la construction et l'analyse de mutants ciblés.
• Réaliser des études d'amarrage moléculaire (docking) avec les substrats et les inhibiteurs, afin de guider l'interprétation des données expérimentales.
• Caractériser l'interaction entre les Ldt et les inhibiteurs synthétisés par les collaborateurs à l'aide de différentes méthodes biophysiques.
• Assurer l'interaction avec les équipes collaboratrices (chimistes, microbiologistes) et la valorisation des résultats (publications, communications en congrès).

2. Participer à la vie du laboratoire :
• Contribuer à la vie collective du groupe de recherche (logistique, suivi des stocks de réactifs, rangement, etc.).
• Participer aux événements scientifiques de l’Institut et aux événements de valorisation.

Votre Profil

Compétences

1. Connaissances fondamentales
• Doctorat en Biologie structurale
• Expertise en biochimie des protéines et biologie structurale (RMN)
• Anglais (écrit/oral) niveau B2

2. Savoir-faire technique
• Biologie structurale : maîtrise avérée de la RMN biomoléculaire (acquisition, traitement, attribution, cartographie d'interactions) ou de la cristallographie aux rayons X (cristallogenèse, collecte au synchrotron, affinement et validation), avec une bonne connaissance de l'autre approche.
• Biochimie des protéines : autonomie en expression hétérologue (E. coli), purification multi-étapes et contrôle qualité des échantillons ; production de protéines marquées isotopiquement (¹⁵N, ¹³C) appréciée pour le volet RMN.
• Caractérisation biophysique des interactions: expérience d'au moins deux techniques parmi ITC, SPR, MST, DSF, fluorescence, SEC-MALS, avec interprétation quantitative des affinités et stœchiométries.
• Biologie moléculaire : clonage, mutagenèse dirigée et conception de constructions.
• Outils informatiques et modélisation : environnement Linux, logiciels de visualisation et d'analyse structurale (PyMOL, ChimeraX) ; des notions d'amarrage moléculaire et de prédiction de structures (AlphaFold) sont bienvenues.

3. Compétences comportementales et relationnelles
• Grande autonomie.
• Proactivité et curiosité scientifique.
• Ouverture d’esprit et écoute active.
• Bon relationnel et capacité d’intégration dans une équipe.

Votre Environnement de Travail

Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l’Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d’envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s’appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu’unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l’IBS est composé de 20 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multidisciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 320 personnes y travaillent chercheurs, doctorants, ingénieurs et techniciens dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée intègrera le groupe RMN qui travaille sur la paroi bactérienne.

Contraintes et risques

Sans.
La recherche se fera indifféremment en français ou anglais, néanmoins il est attendu que le candidat non-francophone s'efforce d'apprendre les bases du français afin de faciliter la communication et son intégration dans le laboratoire.

Rémunération et avantages

Rémunération

entre 3041€ et 3467€ (selon expérience et barème CNRS)

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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Les métiers de la recherche