Missions

Nous recherchons un(e) ingénieur(e) d’étude spécialisé(e) en métabolomique, avec une expertise en spectrométrie de masse (SM), pour contribuer à l’étude du métabolisme de cellules stromales mésenchymateuses issues de tissu adipeux in vitro. Il s’agit de mesurer l’évolution du métabolisme au cours des différentes phases de production des cellules. Dans ce cadre, l’ingénieur(e) contribuera essentiellement à l’analyse détaillée de l'incorporation de carbone C13 dans les métabolites via la SM dans des expériences de traçage isotopique. Il/elle participera également à des analyses de métabolomique. Ces études seront réalisées dans l’équipe METABOLINK de l’institut RESTORE (www.restore-lab.fr) situé sur le site Langlade de Toulouse, en collaboration avec l’équipe GOT-IT, et en lien avec la plateforme MetaToul-MetaboHUB (www.metatoul.fr).…..

Activités

Activités principales :
- Réaliser des analyses de métabolomique et de profilage isotopique par spectrométrie de masse à haute résolution (HRMS), en particulier sur un système LC-MS-Q-Exactive-plus
- Traiter des données isotopiques (isotopologues) acquises par des méthodes non ciblées en LC-HRMS,
- Mener l’analyse biostatistique et mettre en forme les résultats.
Activités associées :
- Travail en collaboration entre 2 équipes de l’Institut RESTORE (METABOLINK et GOT-IT) et en interaction avec les autres partenaires du projet, ainsi qu’avec la plateforme MetaToul-METABOHUB (www.metatoul.fr, analyses métaboliques),
- Rédaction de rapports d’expérience ou d’étude, de notes techniques, de protocoles de laboratoires, participation à la rédaction de publications,
- Communication (interne et externe) sur les résultats obtenus,
- Participation au fonctionnement collectif de l’équipe et du laboratoire (participation aux réunions d’équipe, taches collectives).

Compétences

- Connaissance scientifique dans le domaine de recherche : biochimie, chimie analytique
- Connaissances théoriques et pratiques en spectrométrie de masse et techniques analytiques séparatives, en particulier la chromatographie liquide à haute performance (HPLC) couplée à la spectrométrie de masse.
- Expérience en fluxomique, de la préparation des échantillons à l'analyse des données.
- Maitrise des outils de traitement de données de métabolomique ou de fluxomique
- Programmation informatique (R ou Python),
- Communication, rédaction, transmission de savoir-faire technique,
- ANGLAIS : compréhension orale : niveau I – Compréhension écrire : niveau II

Contexte de travail

Ce poste s’inscrit dans le cadre du projet OPTI-STEM qui vise à démocratiser l’accès à la thérapie cellulaire en France et en Europe, dans le cadre de la stratégie d'accélération « Biothérapies et bioproduction de thérapies innovantes » financée par l’Etat via Bpifrance et par la région Occitanie. Le projet OPTI-STEM vise à optimiser la production de cellules stromales mésenchymateuses dérivées des tissus adipeux (ASC) afin d'en démocratiser l'accès et ainsi permettre la diversification des applications thérapeutiques de ce type de cellules et de leurs dérivés (exosomes, etc.).

Contraintes et risques

La personne peut être amenée à travailler sur plusieurs sites : les sites RESTORE (Campus Oncopole et Campus Rangueil) et ceux de la plateforme MetaToul-MetaboHUB (Campus Rangueil).