Missions

M1 : Caractériser la formation et la résistance des biofilms microbiens sous haute pression hydrostatique pour comprendre leur adaptation à des environnements extrêmes.
M2 : Développer et optimiser des protocoles expérimentaux pour l’incubation de micro-organismes sous pression, en collaboration avec les partenaires du projet PLASDEEP.
M3 : Visualiser et quantifier la structure des biofilms à l’aide de techniques de microscopie avancée et d’analyse d’images.
M4 : Analyser et interpréter les données pour contribuer aux rapports scientifiques et aux publications du projet PLASDEEP (WP2 & WP3).
M5 : Assurer la maintenance des équipements et le respect des normes de sécurité et de qualité en laboratoire.

Activités

Culture microbienne :
Préparer des souches (bactéries/archées), optimiser les milieux de culture et réaliser des inoculations stériles.

Expérimentations sous pression :
Configurer des autoclaves (10-50 MPa), évaluer l’impact de la pression sur la viabilité et la formation de biofilms, et comparer les souches résistantes/sensibles.

Caractérisation des biofilms :
Utiliser la microscopie confocale (CLSM) et électronique (MEB), marquer les composants avec des fluorochromes, et analyser les images via ImageJ.

Analyse et communication :
Traiter les données (R/Excel), rédiger des rapports/protocoles, et présenter les résultats en réunions et conférences.

Maintenance et amélioration :
Assurer l’entretien des équipements, optimiser les protocoles, et former les nouveaux membres de l’équipe.

Veille et innovation :
Effectuer une veille bibliographique, proposer des améliorations méthodologiques, et collaborer avec d’autres laboratoires.

Compétences

Techniques :
Culture microbienne (milieux stériles, biofilms).
Utilisation d'autoclaves haute pression et microscopes (CLSM, MEB).
Analyse d’images (ImageJ) et statistiques (R/Python).

Scientifiques :
Connaissance des mécanismes d’adaptation microbienne et biochimie des biofilms.
Compréhension des interactions physiques dans les biofilms.

Transversales :
Rigueur (protocoles, sécurité).
Collaboration (équipes pluridisciplinaires).
Innovation (veille scientifique, amélioration des méthodes)

Contexte de travail

Créé en 1995, l'Institut de chimie de la matière condensée de Bordeaux (ICMCB) focalise ses recherches sur la Chimie du Solide, la Science des Matériaux et la Chimie et Procédés: concevoir, préparer, mettre en forme et caractériser les matériaux pour découvrir, maîtriser et optimiser des fonctions spécifiques. L'ICMCB réalise des recherches fondamentales sur des matériaux modèles et/ou susceptibles d'avoir des applications.
L'ICMCB est une UMR composée de 280 agents en moyenne (permanents et non-permanents), avec 3 tutelles, hébergée par le CNRS et en ZRR totale.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que l’arrivée de l’agent soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.


Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Chambres haute pression, microscopes
Biologiques/sécurité :
Contamination croisée entre souches.
Toxicité des marqueurs (DAPI, SYTO 9).