Postdoctorant en écologie évolutive (H/F)

Description du Poste

Les Missions

Comprendre la biodiversité et sa dynamique est l'une des questions les plus cruciales de notre époque, dans le contexte inquiétant de son effondrement actuel. Pour y contribuer, le projet ECO-EVO BIODIV propose de développer une approche éco-évolutive (éco-évo) intégrative. Le cadre général du projet inclut les principales facettes de la biodiversité (niveaux de biodiversité, groupes biologiques et variabilité), les forces et les processus qui les façonnent, leur cadre spatio-temporel et leur environnement. ECO-EVO BIODIV est basé sur une large gamme de corpus conceptuels, approches et méthodes dans une perspective interdisciplinaire. Il porte en particulier sur l’analyse de la contribution relative à l’éco-évolution de la plasticité phénotypique et de la variation génétique, de leur rythme relatif et leur base fonctionnelle, dans un contexte d’environnement variable, sur la base d’approches conceptuelles et expérimentales. La plasticité phénotypique est définie comme la capacité d'un génotype à produire des phénotypes alternatifs en fonction des conditions environnementales et peut dans certains cas se révéler adaptative. Longtemps considérée à l’échelle intragénérationnelle, des effets intergénérationnels sur les caractères sont régulièrement démontrés et pourrait permettre des réponses rapides à la variation environnementale.

La partie du projet concernée par la proposition de CDD porte plus particulièrement sur l’étude de cette contribution relative chez deux gastéropodes d’eau douce invasifs aux Antilles françaises (Tarebia granifera et Melanoides tuberculata). Ces espèces, phylogénétiquement et écologiquement proches, se reproduisent clonalement – les clones peuvent être distingués visuellement, et sont en interactions compétitives. La dynamique des clones et espèces est suivie en Martinique depuis plusieurs décennies (près de 200 sites). Elles sont depuis peu soumises à la prédation par une écrevisse elle-même invasive. Dans ce contexte d’interactions biotiques (compétition et prédation), l’objectif est d’évaluer comment les traits (histoire de vie, morphologie, comportement), et par conséquent la valeur sélective, sont influencés par la compétition intraspécifique et interspécifique chez les escargots, et par la prédation des écrevisses. Ces résultats seront intégrés à l’analyse des trajectoires démographiques en Martinique, et possiblement à des résultats de modélisation.

L'Activité

Dans ce contexte, la personne recrutée aura en charge la partie du projet qui vise à caractériser les réponses phénotypiques à la prédation (écrevisses) des deux espèces de gastéropodes et des clones mais aussi au sein des clones, au sein et entre générations (plasticités intra- et intergénérationnelle). Ce travail sera principalement basé sur la réalisation d’expérimentations en laboratoire permettant de caractériser divers traits d’histoire de vie et comportementaux. En fonction de l’affinité de la personne recrutée, une caractérisation fine de la morphologie (e.g. analyse 3d) pourra être envisagée. Les missions seront donc de (i) construire des protocoles expérimentaux permettant de tester les hypothèses exposées dans le projet, (ii) réaliser les expérimentations longues, (iii) analyser les données par des méthodes statistiques appropriées (iv) interpréter et valoriser sous la forme d’articles scientifiques. Ces données seront comparées à des données obtenues par ailleurs dans d’autres contextes expérimentaux, au laboratoire et sur le terrain. Elles permettront aussi de comprendre la dynamique des escargots et écrevisses dans les milieux d’eau douce de Martinique. La personne recrutée aura l’opportunité de participer à une mission de terrain en Martinique et éventuellement à des expérimentations in situ. Elle mènera ces travaux en collaboration avec d’autres personnes participant au projet (incluant étudiant.e.s, post-doctorant.e.s, et l’ingénieur en charge du suivi du projet ECO-EVO BIODIV), et participera à toute la chaine de travail, de la conception à la publication.

Les candidat.e.s devront fournir :
- Une lettre de motivation résumant leurs expérience et intérêt en recherche, en relation avec le poste proposé et les sujets à développer
- Un curriculum vitae (5 pages maximum)
- Les noms et coordonnées de deux personnes avec lesquels les candidat.e.s ont travaillé directement – elles pourront être contactées si les candidat.e.s sont retenu.e.s pour un entretien.

Votre Profil

Compétences

Les candidat.e.s doivent être titulaire d’un doctorat dans les domaines de l’écologie ou de la biologie évolutive et posséder une forte appétence pour l’approche expérimentale (élaboration de protocole, élevage, phénotypage)

Compétences requises :
- Expérience des approches expérimentales (laboratoire) sur des modèles animaux, possiblement des suivis à long terme ou de l’expérimentation sur le terrain
- Analyses de données (par ex., sous R) et manipulation de base de données
- Capacité à travailler de façon indépendante et en équipe
- Capacité à interagir avec des interlocuteurs scientifiques et non scientifiques
- Expérience de rédaction scientifique (par ex., articles, rapports)
- Très bon niveau de communication (écrite et orale) en français et anglais

Compétences utiles :
- Expérience de travail sur des organismes aquatiques
- Goût pour l’interdisciplinarité

Votre Environnement de Travail

Le travail sera mené au Laboratoire d’Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés (LEHNA) à Lyon (France ; https://umr5023.univ-lyon1.fr/) en collaboration avec le Centre d’Ecologie fonctionnelle et évolutive (CEFE) à Montpellier (France ; https://www.cefe.cnrs.fr), selon les règles de fonctionnement (par ex., horaires, congés) du CNRS. Les recherches au LEHNA couvrent un gradient de domaines allant des sciences de l’évolution aux sciences de l’environnement en passant par l’écologie évolutive et l’écologie fonctionnelle. Ces thèmes sont développés à différents niveaux d’organisation, depuis l’individu jusqu’à l’écosystème. Les objets d’étude principaux sont les milieux aquatiques et les organismes qui les habitent. La personne recrutée intégrera l’équipe Biodiversité et Adaptations dans les Hydrosystèmes du LEHNA qui s’intéressent aux processus micro-évolutifs et écologiques, et à leurs interactions dans les hydrosystèmes à l’aide de différentes approches et sur différents modèles biologiques. Elle possède en particulier une forte expertise sur le travail de terrain en milieux aquatiques et la réalisation d’expérimentations en conditions contrôlées, avec notamment une plateforme d’expérimentation pour l’étude des mollusques gastéropodes (d’autres outils et dispositifs sont disponibles au sein du laboratoire). Le CEFE est l’un des plus grands laboratoires d’écologie français, et un endroit particulièrement approprié pour mener des travaux interdisciplinaires en éco-évolution. Le projet ECO-EVO BIODIV est porté au sein de l’équipe Génétique et Ecologie Evolutive (GEE) du CEFE. Les deux équipes concernées (LEHNA et CEFE) collaborent depuis une quinzaine d’années sur des questions de biologie évolutive et de plasticité. Des séjours pourront être envisagés au CEFE.

Pour plus d’informations, merci de contacter Emilien Luquet (emilien.luquet@univ-lyon1.fr), Sandrine Plénet (sandrine.plenet@univ-lyon1.fr), Axel Gayot (axel.gayot@cefe.cnrs.fr) et Philippe Jarne (philippe.jarne@cefe.cnrs.fr).

Contraintes et risques

- respect des règles d’hygiène et sécurité (en laboratoire et sur le terrain) et d’expérimentation animale
- mission de terrain aux Antilles
- travail en animalerie aquatique sur matériel vivant (incluant coordination avec les autres membres du projet, si nécessaire)

Rémunération et avantages

Rémunération

a partir de 3 071€ brut mensuel selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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