Missions

Un poste de chercheur(e) post-doctorant dans les mécanismes moléculaires de sécrétion d'exopolysaccharides (EPS) bactériens sous contrôle du messager secondaire c-di-GMP (ANR T-ERC CoG). Les systèmes de sécrétion d'EPS bactériens sont des macrocomplexes membranaires qui jouent un rôle important dans formation de biofilms, la physiologie cellulaire et la pathogénicité bactériennes, et constituent des cibles importantes dans le développement de nouveaux médicaments anti-infectieux. Ce projet vise à comprendre les mécanismes moléculaires de la fonction et la pharmacologie de ces systèmes macromoléculaires. Ce poste est affecté au laboratoire CBMN (UMR5248), au sein de l'équipe du Dr Petya Krasteva dont la thématique est la 'Biologie Structurale des Biofilms'.

Activités

- Développement de protocoles pour l'expression et la purification des protéines et complexes membranaires, cytosoliques et/ou périplasmiques dans différents systèmes hétérologues. Y compris les cultures à petite et à grande échelle. - Développement et réalisation de tests de solubilisation et de stabilité des protéines, ainsi que des essais fonctionnels. - Preparation d'échantillons pour des études in situ par cryotomographie électronique (cryo-ET). - Collecte de données aux synchrotrons (sources de rayons X et cryomicroscopes électroniques de dernière génération) en France et à l'étranger. - Préparation d'échantillons pour la cryomicroscopie électronique, collection et analyses de données. - Analyse de la littérature scientifique, préparation d'exposés hebdomadaires, communication scientifique

Compétences

Compétences recommandées - Production et purification d'ADN plasmidique en quantités de milligrammes. - Clonage, mutagenèse, conception de constructions d'expression et protocoles de biologie moléculaire - Purification des protéines (membranaires), y compris les écrans de solubilisation à haut débit et les techniques de chromatographie liquide. - Caractérisation biochimique des protéines incluant des connaissances en enzymologie. - Cristallisation de protéines. - Collecte des données de diffraction des rayons X et détermination de la structure. - Microscopie électronique à particules uniques et par cryotomographie - Expérience avec le traitement de données cryo-EM et cryo-ET - Expérience dans la formation d'étudiants et de post-doctorants -Expérience dans l'organisation de voyages vers des synchrotrons ou d'autres installations pour la collecte de données, ainsi que dans la gestion de données de diffraction / cryo-EM.

Les compétences ci-dessus sont souhaitées mais pas obligatoire. Le/la recruté.e sera formé.e aux méthodes spécifiques.

Contexte de travail

L'équipe du Dr Krasteva à intègré en Octobre 2019 l'Institut Européen de Chimie et Biologie à Pessac. Il s'agit d'un incubateur d'équipes projet travaillant autour de la chimie et de la biologie. Le(la) chercheur(e) post-doctorant bénéficiera d'un environnement scientifique extrêmement stimulant, et de l'accès à des plateformes technologiques. L'offre est pour un contrat de 6 mois financé sur un projet ERC avec prolongation possible selon les performances du/de la recruté.e.

Contraintes et risques

Risques standards de laboratoire de recherche en biologie (Niveaux de sécurité biologique BSL1 et BSL2). Protocoles de sécurité établis et à suivre.

Informations complémentaires

ANR T-ERC COG