Missions

Le projet postdoctoral fait partie du projet ChromSwitch financé par l'ANR, qui vise à étudier une fonction qui antagonise la répression chromatinienne médiée par Polycomb PRC2 des gènes de développement chez les plantes.
Les principaux objectifs du projet postdoctoral sont (1) de caractériser finement un facteur associé à PRC2, portant cette fonction de commutation, incluant ses caractéristiques moléculaires ; et (2) de résoudre son interaction et son mécanisme d'opposition au PRC2.
Pour ce faire, le chercheur aura pour mission de développer des approches moléculaires et génétiques ainsi que des outils pour les analyses épigénomiques/épigénétiques et intéractomiques.

Activités

Le chercheur post-doctoral développera son projet sous la supervision directe de C. Carles (PR UGA, responsable de l'équipe) et de G. Vachon (chercheur CNRS dans l'équipe). Le post-doctorant bénéficiera du réseau de collaborations de l'équipe à Grenoble, au sein du consortium ANR ChromSwitch. En particulier, la personne travaillera en étroite interaction avec l'ingénieur permanent en charge des travaux de génétique moléculaire végétale (M. Le Masson), ainsi qu'avec notre partenaire de l'Institut de Biologie Structurale (IBS).

Les activités pourront inclure :
- Profilage des marques épigénétiques et des protéines à l'échelle du génome : ChIP-seq, Bisulfite-seq
- analyses in vitro des interactions protéine-ADN : EMSA, anisotropie de fluorescence, résonance plasmonique de surface
- essais fonctionnels in vivo : Tests de la luciférase (protoplastes), analyses de complémentation des mutants (Arabidopsis thaliana)
- Intéractomique : IP-MS, ChIP-MS, Split-BioID-MS ; Y2H, BiFC ou Split-Luciférase
- immuno-localisation in cyto

En outre, le post-doctorant présentera ses données en anglais lors de réunions d'équipe et de séminaires de laboratoire, et participera à l'analyse d'articles scientifiques liés à sa recherche, et les discutera avec les membres de l'équipe (par exemple en « journal clubs »).

Compétences

Le candidat doit avoir un profil adéquat pour développer des approches de biologie moléculaire et de génétique végétale pour les analyses épigénomiques/épigénétiques et intéractomiques. Le candidat doit :

- maîtriser les bases (théorie et pratique) de la génétique/épigénétique et de la biologie moléculaire.
- être familiarisé avec les méthodes d'analyse et de mesure de l'expression des gènes et des marques épigénétiques, et leur exploitation bioinformatique.
- être autonome dans la conception de plans expérimentaux, l'interprétation et la présentation des résultats lors de réunions d'équipe et de séminaires
- développer des outils et des méthodes et les utiliser de manière fiable et reproductible.
- être capable de contribuer à la préparation de publications scientifiques.
- être capable de travailler de manière indépendante dans un environnement interdisciplinaire et international
- être prêt à interagir scientifiquement au sein d'un groupe de recherche dynamique
- respecter les règles et les procédures du laboratoire
- parler couramment l'anglais.

Contexte de travail

Le chercheur fera partie de l'équipe ChromDev (http://www.lpcv.fr/en/ChromDev) du Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale (UMR 5168 - CNRS -CEA - Univ. Grenoble Alpes - INRAE) à Grenoble. Les projets de l'équipe visent à mieux comprendre les dynamiques chromatiniennes qui régulent les transitions développementales chez les plantes, en utilisant une stratégie multidisciplinaire, englobant des analyses phénotypiques in vivo, des études omiques (épigénomique, transcriptomique, intéractomique) et la caractérisation in vitro des interactions moléculaires et des structures 3D des complexes protéiques.

Ce poste sera à pourvoir sur le campus du Polygone à Grenoble, un environnement riche pour la recherche en biologie, à proximité de plusieurs laboratoires tels que l'IBS, l'IRIG, l'ESRF et l'EMBL. L'institut LPCV emploie une centaine de personnes et dispose d'équipements de pointe en biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale et imagerie. Il dispose d'installations de culture de plantes permettant de réaliser toutes les étapes de la génétique moléculaire sur Arabidopsis. Le groupe ChromDev comprend une douzaine de membres (permanents, jeunes chercheurs, stagiaires), dont des généticiens, des biologistes moléculaires et des biochimistes.

Contraintes et risques

Pas de contrainte ou risque majeur.