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Thèse en imagerie et stimulation optique de l'axe intestin-cerveau (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : mercredi 21 avril 2021

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Informations générales

Référence : UMR7357-MICGOR-003
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : mercredi 31 mars 2021
Nom du responsable scientifique : Michalina Gora
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 septembre 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2 135,00 € brut mensuel

Description du sujet de thèse

Le but du projet est de développer une nouvelle méthode pour étudier l'axe microbiote-intestin-cerveau in vivo. Le/La candidat/candidate retenu/e concevra et développera un nouveau endomicroscope qui combine la tomographie par cohérence optique (OCT) et l'optogénétique pour cartographier la morphologie et la fonctionnalité du système nerveux entérique chez les petits animaux. Cela comprend le développement d'un système optique multimodal et d'un cathéter micro-optique pour guider la lumière dans le système digestif. Cette technologie sera testée dans des expériences de laboratoire et ex vivo dans le but ultime d'analyser l'état du réseau neuronal de l'intestin dans diverses conditions digestives.

Nous recherchons un/une candidat/candidate enthousiaste et indépendant/e pouvant participer à un projet interdisciplinaire qui implique la photonique, la gastro-entérologie et les neurosciences. Le/La candidat/candidate doit avoir d'excellentes compétences en communication et une expérience dans des domaines de génie biomédical, génie optique, génie mécanique, optomécatronique, robotique médicale, vision, traitement d'image ou domaines connexes. Familiarité avec tomographie par cohérence optique, optogénétique, microscopie confocale, imagerie endoscopique, systèmes d'imagerie optique pour applications biomédicales, traitement d'images et de signaux sera un plus.

Contexte de travail

Le projet sera mené dans le groupe de recherche du Dr Michalina Gora qui est hébergé par le CNRS et le laboratoire ICube. Le laboratoire ICube rassemble des communautés scientifiques issues des domaines de l'ingénierie, de l'informatique et de l'imagerie médicale. Il pourvoit l'accès à diverses plates-formes avec des équipements qui sont nécessaires au bon déroulement du projet, notamment le système de prototypage rapide multimatériel 3D, la plate-forme préclinique sur site avec IRM pour petits animaux, l'imagerie par fluorescence et le sectionnement histologique, l'anesthésie animale et le système de surveillance, 5 microscopes optiques et un ensemble d'équipements pour le développement de l'instrumentation photonique. L'équipe travaillera en étroite collaboration avec la Dre Laura Harsan, experte en stimulation optogénétique du cerveau et en imagerie IRMf. En outre, la ville de Strasbourg offre un environnement particulièrement riche pour la recherche translationnelle et clinique avec de nombreuses infrastructures et instituts qui peuvent assurer la réussite du projet proposé, comme l'institut de chirurgie mini-invasive IRCAD, axé sur le développement de nouvelles technologies de diagnostic et traitements mini-invasifs, ainsi que l'Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives.

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