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Ingénieur en modélisation du vivant (H/F)

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Français - Anglais

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Informations générales

Référence : USR3505-CAMLIB-017
Lieu de travail : TOULOUSE
Date de publication : mercredi 29 juillet 2020
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 6 mois
Date d'embauche prévue : 21 septembre 2020
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2088€ et 2351€ brut mensuel
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

• Mettre à jour d'un modèle agents d'interaction CTL / cellules cancéreuses
• Développer des outils de design et d'optimisation de protocoles expérimentaux
• Analyser des données de validation expérimentales

Activités

Nous recherchons un(e) ingénieur(e) d'étude en modélisation du vivant qui travaillera sous la supervision du Dr Sylvain Cussat-Blanc. Il/Elle sera accueilli(e) à l'Institut des Technologies Avancées en sciences du Vivant (ITAV CNRS USR3505), Toulouse, France. L'objectif de ce projet interdisciplinaire est de développer (1) un outil de calibration automatique et (2) des outils de conception et d'optimisation de protocoles expérimentaux pour un modèle d'interaction cellule T/cellule cible déjà calibré sur des cellules de mélanome et des lymphocytes T cytotoxiques [Kazhen et al. 2019, Rapport scientifique]. Le but est de pouvoir indivualiser un modèle orienté agent en utilisant des données provenant d'échantillons de patients et/ou de nouveaux types de cellules. Pour cela, des indicateurs statistiques devront être proposés afin d'évaluer à la fois la qualité des données expérimentales et les résultats des simulations. Une fois calibrée, la plateforme de simulation devra être utilisable par les biologistes pour développer et optimiser de nouveaux protocoles expérimentaux et évaluer leurs résultats via le modèle.

Compétences

Nous recherchons un(e) candidat(e) talentueux(se), titulaire d'un master en informatique, pour travailler dans un environnement de recherche multidisciplinaire. Une expérience dans la modélisation de systèmes biologiques est requise, avec de préférence une bonne connaissance du cancer. Le/la candidat(e) doit être créatif, très motivé et posséder de bonnes compétences en matière de rédaction de publications scientifiques.

Contexte de travail

L'agent sera affecté à l'ITAV, unité de service et de recherche de 50 personnes, dans l'équipe de recherche Onko3D, sous la responsabilité de Sylvain Cussat-Blanc (voir https://www.itav.fr/portfolio_page/onko3d/)

Le projet sera mené en étroite collaboration avec le Dr Salvatore Valittuti (CRCT INSERM U1037), immunologiste et pathologiste, expert en synapses immunologiques. Le/la candidat(e) travaillera avec un(e) post-doctorant(e) en immunologie qui produira des données expérimentales pour calibrer et/ou valider le modèle tout au long de son processus de développement.

Contraintes et risques

Aucun

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