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H/F OFFRE DE POSTDOCTORAT: dsRNA-sensing lors d'interactions plante-virus

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : mardi 8 décembre 2020

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Informations générales

Référence : UPR2357-CHRRIT-002
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : mardi 17 novembre 2020
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 février 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2675 € et 3084 € bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

L'ARN double brin (ARNdb) est considéré comme une caractéristique universelle de l'infection d'organismes cellulaires par des virus qui possèdent un génome à ARN. L'ARNdb sert également de substrat essentiel dans la réponse antivirale de l'hôte via le système immunitaire inné, y compris la voie de silencing de l'ARN chez les plantes. Si un grand nombre de protéines de liaison à l'ARNdb ont déjà été identifiées, principalement chez l'animal, il n'y a pas actuellement d'études systématiques et exhaustives dans les plantes permettant une vision globale de ces facteurs et de leurs fonctions dans des conditions normales et pathologiques.
Dans le cadre d'un projet de 4 ans financé par l'ANR impliquant les équipes de Pascal Genschik, Véronique Ziegler-Graff et Christophe Ritzenthaler (IBMP), notre consortium vise à démêler les mécanismes moléculaires impliqués dans du sensing de ARNdb par la machinerie de l'hôte lors de l'infection des plantes par des virus. Pour répondre à ces objectifs, nous proposons de tirer parti des nouveaux outils développés à l'IBMP [1-3] pour capturer l'ARNdb et les facteurs associés basés sur le domaine de liaison à l'ARNdb dérivé de la protéine B2 du virus Flock house.
References
1. Incarbone M, Scheer H, Hily J.-M, Kuhn L, Erhardt M, Dunoyer P, Altenbach D, Ritzenthaler C. Characterization of a DCL2-Insensitive Tomato bushy stunt virus isolate infecting Arabidopsis thaliana. Viruses 2020, 12, 1121.
2. Incarbone M, Clavel, M, Monsion, B, Kuhn, L, Scheer, H, Poignavent, V, Dunoyer, P, Genschik, P, Ritzenthaler, C. Immunocapture of dsRNA-bound proteins provides insight into Tobacco rattle virus replication complexes and reveals Arabidopsis DRB2 to be a wide-spectrum antiviral effector. bioRxiv 2020, 842666.
3. Monsion B, Incarbone M, Hleibieh K, Poignavent V, Ghannam A, Dunoyer P, Daeffler L, Tilsner J, Ritzenthaler C. Efficient detection of long dsRNA in vitro and in vivo using the dsRNA binding domain from FHV B2 Protein. Front Plant Sci 2018, 9, 70.

Activités

Le/la candidat(e) purifiera les complexes associés à l'ARNdb de plantes saines et infectées par les virus et effectuera la caractérisation fonctionnelle des composants de l'hôte identifiés. L'étude comprendra des virus systémiques et phloémiens afin de fournir une vue d'ensemble des complexes de ribonucléoprotéiques et des ARNdb (à la fois cellulaires et viraux) régulés différentiellement pendant l'infection.

Compétences

- La qualification minimale: doctorat en biologie moléculaire, biochimie, biochimie structurale ou biologie cellulaire.
- Le/la candidat(e) idéal(e) pour ce poste doit être très motivé, posséder d'excellentes compétences en communication verbale et écrite, des compétences en leadership et des capacités de réflexion et de résolution de problèmes.
- Une expérience préalable en biologie de l'ARN, virologie, biochimie ou génétique végétale sera un plus.
- Le/la candidat(e) doit avoir la capacité de travailler dans une équipe multidisciplinaire.
- Le/la candidat(e) doit avoir fait ses preuves par la publication d'articles évalués par des pairs, le sens de l'organisation, le souci du détail et doit posséder une solide éthique de travail.

Contexte de travail

L'IBMP fournit un excellent environnement scientifique et est entièrement équipé des équipements de pointe nécessaires pour réaliser les projets, y compris en spectrométrie de masse, imagerie, séquençage, et en bioinformatique.

Contraintes et risques

Risques associés aux techniques de biologie moléculaire, de biochimie et de manipulation de plantes

Informations complémentaires

Les lettres de motivations adressées à Christophe Ritzenthaler devront être soumises via la plateforme de recrutement.

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