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Développeur et gestionnaire de données en bioinformatiques (H/F)


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Informations générales

Référence : UMS3601-VALSAI-011
Lieu de travail : EVRY
Date de publication : lundi 6 mai 2019
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 1 juin 2019
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2139,18 à 2401,13€ bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

- Développer un service mutualisé d'espace de stockage et partage de données, accessible aux
différentes INBS, hébergé sur les ressources matérielles de l'IFB.
- Monter en compétence sur la thématique du data management , afin de mettre en place un
plan de gestion des données avec les premiers utilisateurs du service.

Activités

- Développement informatique, pour mettre en place une offre d'espaces projets partagés.
- Gestion du projet de développement, en lien avec la taskforce cluster de l'IFB.
- Accompagnement utilisateur.
- Gestion des données, établissement de plans de gestions à l'échelle des projets.

Compétences

Expérience
- Un minimum de 1 an d'expérience professionnelle est exigé.
- Master 2 en informatique ou bioinformatique
Compétences opérationnelles
- Maîtrise de Linux
- Maîtrise d'au moins un langage de scripting (Python…)
- Maîtrise de l'outils de versionning git.
- Bonne connaissance des solutions de conteneurs et de gestion d'infrastructures pour
applications conteneurisés
- Connaître les outils de gestion de données ou les systèmes de stockage serait un plus apprécié.
- Notions générales en “Data Management“ (plans de gestion de données, RGPD, etc.)
- Notion sur l'usage d'une infrastructure de type HPC/Cluster
- Notions sur un outil de déploiement automatique (Ansible, Salt, ...) serait un plus
- Compréhension de l'anglais oral et écrit
- Etre capable de documenter
Compétences comportementales
- Savoir travailler en équipe, parfois à distance des collaborateurs, est essentiel.
- Capacité à travailler en mode projet et en équipe.
- Réactivité, autonomie, initiative, rigueur.
- Esprit d'équipe et sens de la collaboration.
- Capacité d'écoute et sens du contact.

Contexte de travail

L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) est une infrastructure nationale de support à la
recherche, qui regroupe 31 plateformes de bioinformatique réparties sur le territoire, et une unité
coordinatrice, IFB-core (UMS 3601, CNRS). Ses missions principales sont les suivantes.
● Déployer une infrastructure physique et logicielle de services en bioinformatique.
● Offrir un appui aux programmes de recherche en biologie, santé, environnement,
biotechnologies et agronomie, via une expertise et des compétences mutualisées.
● Proposer des formations continues en bioinformatique pour biologistes et bioinformaticiens.
● Développer une vision stratégique pour maintenir la France au plus haut niveau d'expertise
pour l'analyse des données biologiques, et donner accès aux technologies de pointe dans le
domaine bioinformatique.
● Développer des outils innovants pour répondre aux défis de la bioinformatique intégrative.
● Servir de levier pour la conception et la mise en oeuvre de projets de recherche nationaux
ambitieux.
● Assurer la représentation internationale de la communauté bioinformatique française, en
particulier au sein du réseau européen ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/).
Parmi les actions définies pour le développement de cette Infrastructure figure la mutualisation des
ressources entre les grandes Infrastructures Nationales en Biologie et Santé (INBS), comme par
exemple France Génomique ou France Imaging.
Dans ce but, l'IFB recrute un développeur en informatique, intéressé à travailler dans le domaine de
la bioinformatique, et prêt à s'investir dans la gestion des données (Data Management), leur cycle de
vie, et l'établissement d'un plan de gestion.

Contraintes et risques

L'agent qui occupera ce poste sera affecté administrativement à la délégation Paris Ile de France Sud.

Plusieurs lieux sont envisageables selon nos plateformes d'hébergement :
- Université de Bordeaux UMR5800
- Station Biologique de Roscoff UMR8227
- ou IGBMC Strasbourg UMR7104.

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