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Portail > Offres > Offre UMR8227-FRATHO-001 - Assistant(e) Ingénieur(e) Biologie Moléculaire et Microbiologie (H/F)

Assistant(e) Ingénieur(e) Biologie Moléculaire et Microbiologie (H/F)


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Informations générales

Référence : UMR8227-FRATHO-001
Lieu de travail : ROSCOFF
Date de publication : lundi 3 décembre 2018
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 18 mois
Date d'embauche prévue : 18 février 2019
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 1 913 et 2050 € bruts selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+2
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Adapter et appliquer les techniques de biologie moléculaire et microbiologie pour la culture, la préparation et l'analyse génomique, métagénomique et métatranscriptomique de bactéries associées aux macroalgues, dans le cadre du projet ANR Jeunes Chercheur(e)s ALGAVOR.

Activités

- Collecte d'échantillons biologiques (algues, biofilms, fractions microbiennes)
- Isolement, mise en collection et caractérisation de nouvelles souches bactériennes marines
- Extraction et préparation des ADN/ARN issus d'échantillons marins
- Réalisation de réactions de séquences, PCR, qPCR et RT-qPCR
- Construction de banques métagénomiques pour le séquençage haut débit
- Participation au suivi des analyses de données et présentation des résultats
- Participation à la gestion des stocks et de produits consommables au laboratoire

Compétences

- Compétences solides en biologie moléculaire (clonage, PCR, séquençage Sanger et Illumina) et en microbiologie (cultures bactériennes, isolements)
- Maîtrise des techniques de préparation et d'analyse d'échantillons biologiques
- Une expérience en microbiologie marine et/ou sur les macroalgues est attendue
- Rigueur, autonomie et sens de l'organisation
- Savoir lire et comprendre l'anglais technique

Contexte de travail

Le poste s'inscrit dans le projet de recherche ALGAVOR porté par François Thomas et récemment financé par l'Agence Nationale de la Recherche (2018-2024) au sein du "Laboratoire de Biologie intégrative des modèles marins» à Roscoff. Le projet vise à explorer les stratégies écologiques et métaboliques de bactéries marines spécialistes de la dégradation des macroalgues, avec un focus sur le genre Zobellia. Il intègre des approches culture-dépendantes et 'omiques pour (i) évaluer la biodiversité, distribution, abondance, activité et les fonctions cataboliques de Zobellia spp. dans les environnements marins, (ii) déchiffrer les voies métaboliques nécessaires pour dégrader la biomasse algale fraîche et (iii) étudier les interactions métaboliques avec des bactéries opportunistes qui profitent des produits de dégradation. Au sein de ce projet, le travail proposé s'inscrit principalement dans la tâche 1. Il sera mené au sein de l'équipe "Glycobiologie Marine" de l'unité.

Contraintes et risques

Des collectes d'échantillons à pied sur le terrain (algues, eau de mer, etc.) sont à prévoir.

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