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Portail > Offres > Offre UMR8199-HELDEG0-002 - Ingénieur en développement et déploiement d'applications (H/F)

Ingénieur en développement et déploiement d'applications (H/F)


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Informations générales

Référence : UMR8199-HELDEG0-002
Lieu de travail : LILLE
Date de publication : vendredi 18 mai 2018
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 juillet 2018
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2090 et 2500 euros brut
Niveau d'études souhaité : Bac+3
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

L'ingénieur choisit, développe et met en place des techniques d'analyse de données, dans le cadre des projets scientifiques des équipes de recherche. Il assure également la maintenance des développements et suit les évolutions dans ce domaine.

Activités

Activités principales :

• Réaliser l'acquisition et assurer la gestion et l'analyse de données provenant de séquenceurs de nouvelle génération Illumina
• Développer, administrer et maintenir des bases de données
• Développer des outils d'annotation et de sélection de variants
• Développer des outils bioinformatiques et les déployer sur un serveur intranet

Activités associées :

• Organiser la mise en forme, le stockage des données
• Assurer une veille technologique
• Évaluation du besoin informatique
• Réalisation de supports de communication

Compétences

Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires

• Bonnes connaissances de l'environnement Windows
• Bonnes connaissances de l'environnement Unix/Linux
• Connaissance de langages de programmation (Perl, Python, Shell, R)
• Maitrise des bases de données (Mysql, NoSQL) et du language SQL


Savoir-faire opérationnels

• Connaissance d'outils d'alignement de séquences
• Connaissance d'outils de découverte de variants génétiques
• Aide à l'annotation et la sélection de variants

Compétences linguistiques

• Anglais : Expression écrite et orale : niveau 1
• Anglais : Compréhension écrite et orale : niveau 2

Contexte de travail

Environnement et contexte de travail :

L'IE exercera son activité au sein de l'UMR 8199 qui fait partie de l'EGID (European Genomic Institute for
Diabetes), institut international de recherche axé sur le diabète de type 2, l'obésité et les facteurs de
risque associés.

Informations complémentaires

Formations et expérience professionnelle souhaitables

Expérience dans le domaine de la recherche en génétique humaine.
Expérience dans l'analyse de données issues des nouvelles technologies de séquençage à très haut débit .
Connaissance des maladies métaboliques humaines (diabète, obésité,…)
Connaissance en génétique
Connaissance des banques de données biologiques (NCBI, UCSC, Ensembl, dbSNP, ExAC)
Expérience en analyse de données biologiques à grande échelle

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