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Portail > Offres > Offre UMR8197-NATBOI-052 - Ingénieur d'étude Intégration des données multi-omiques cellules uniques (H/F)

Ingénieur d'étude Intégration des données multi-omiques cellules uniques (H/F)


Date Limite Candidature : vendredi 11 décembre 2020

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Informations générales

Référence : UMR8197-NATBOI-052
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : vendredi 20 novembre 2020
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Salaire brut mensuel compris entre 2150 et 2422 euros selon expérience
Niveau d'études souhaité : Ingénieur
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Développement d'approches pour l'intégration des données multi-omiques cellules uniques.

Activités

La personne recrutée sera le contributeur principal du projet ANR JCJC scMOmix. Il/Elle travaillera sur le développement d'approches d'intégration de données multi-omiques cellules uniques. Ces approches s'appuieront sur le transport optimal, sous la co-supervision de Gabriel Peyré (DMA) et Laura Cantini (IBENS). Les résultats attendus sont la validation d'une méthodologie d'analyse intégrative de ces données, et l'implémentation de cette méthodologie dans un outil open-source.

Compétences

Une formation en mathématique appliqué et/ou machine learning est requise. La connaissance de la théorie du transport optimal et des données cellules uniques seront considérés comme un plus.

Contexte de travail

L'Institut de biologie de l'ENS (IBENS) est un centre de recherche fondamentale qui mène des recherches originales visant à décrypter les mécanismes fondamentaux au cœur des processus biologiques.
Unité mixte ENS-CNRS-INSERM, l'IBENS accueille plus de 300 personnes regroupées en 30 équipes autonomes conduisant une recherche hautement collaborative et multidisciplinaire qui allie approches expérimentales et théoriques.
L'activité de recherche couvre des champs thématiques variés : Neurosciences, Biologie du développement, Génomique fonctionnelle, Écologie et biologie de l'évolution.
Plusieurs plateformes technologiques, notamment en imagerie, génomique, protéomique et bio-informatique sont à la disposition des chercheurs. Les recherches menées à l'IBENS bénéficient des interactions avec d'autres disciplines présentes à l'ENS (physique, chimie, sciences cognitives, mathématiques). L'IBENS est activement impliqué dans la formation des étudiants et jeunes chercheurs à tous les niveaux.
L'équipe d'accueil Computational Systems Biology (CSB), dirigée par Denis Thieffry comprend deux Enseignants-chercheurs et deux chercheurs permanents.
L'objectif de l'équipe est de developper des algorithmes pour l'analyse des données omiques et la modélisation des réseaux cellulaires.
Le/la candidat.e travaillera en étroite collaboration avec l'équipe de Gabriel Peyré du DMA (ENS).

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