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Postdoc phylogénomique des protistes (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

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Informations générales

Référence : UMR8079-LAUEME-003
Lieu de travail : ORSAY
Date de publication : vendredi 27 septembre 2019
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 décembre 2019
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 3784 et 5282 € bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Le(a) candidat(e) participera au projet ERC Starting Grant Macro-EpiK, qui vise à mieux connaître les diversité et l'évolution des génomes eucaryotes avec une emphase sur le rôle des transferts horizontaux de gènes (HGT).
Dans ce cadre, le(a) candidat(e) participera à la détection et l'analyse bioinformatique des HGT dans divers génomes eucaryotes générés et assemblés au laboratoire.

Activités

Les activités concernent :
- le développement d'un programme d'identification automatisée des HGT reposant sur la phylogénie moléculaire ;
- L' application de ce programme sur plusieurs génomes de protistes ;
- l'analyse bioinformatique de diverses caractéristiques des transferts identifiés.
- Le co-encadrement d'étudiants en M2 ou doctorat

Compétences

Nous considérerons des candidats de préférence avec un excellent niveau de connaissances en analyse phylogénétique et de génomique comparée à grande échelle (i.e., à l'échelle des eucaryotes). De plus, il est indispensable que le candidat devra être à l'aise avec au moins un langage de programmation (Perl ou Python de préférence).
Autres compétences requises :
Langues anglais (écrit, oral).
Bonne capacités de présentation et de communication.
Autonomie, capacité d'organisation.
Capacités de synthèse et d'analyses critiques.

Contexte de travail

L'unité Ecologie, Systématique et Evolution (ESE) est un laboratoire CNRS - Université Paris-Sud - AgroParisTech, localisé sur le campus de l'Université Paris-Sud, Université Paris-Saclay à Orsay. Le campus est situé à 20 kms au sud de Paris et facilement accessible en RER.

Le(a) candidat(e) mènera son travail au sein de l'équipe DEEM (Diversité, Ecologie et Evolution Microbiennes: http://www.deemteam.fr) qui s'intéresse à la diversité des microorganismes et à leur évolution en utilisant des approches de phylogénie moléculaire et de génomique comparative. Le(a) candidat(e) travaillera en collaboration étroite avec les autres membres de l'équipe impliqués dans le projet Macro-EpiK et sera sous la direction de Laura Eme (laura.eme@u-psud.fr).

Contraintes et risques

Pas de risques identifiés.

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